| 酵母基因组中核小体偏好序列的识别 |
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| 引用本文： | 陈伟,罗辽复.酵母基因组中核小体偏好序列的识别[J].生物信息学,2009,7(2). |
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| 作者姓名： | 陈伟 罗辽复 |
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| 作者单位： | 内蒙古大学物理科学与技术学院,内蒙古,呼和浩特,010021 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目 |
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| 摘 要： | 应用多样性增量结合二次判别分析(Increment of Diversity with Quadratic Discriminant analysis,IDQD)方法,对酵母基因组中的核小体强/弱偏好序列进行了识别.10交叉检验的预测成功率超过了97%,受试者操作特性(receiver operating characteristic,ROC)曲线下面积达到了0.99,预测成功率高于现有SVM算法.最后利用构建好的分类器对酵母基因组中三类包含TATA盒基因的起始密码子ATG上游400nt下游100nt区域进行了分析.结果表明,IDQD算法有能力应用于基因组中核小体序列的识别.
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| 关 键 词： | 核小体 多样性增量 二次判别分析 |
Prediction of nucleosome preferred sequences in yeast genome |
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| CHEN Wei,LUO Liao-fu.Prediction of nucleosome preferred sequences in yeast genome[J].China Journal of Bioinformation,2009,7(2). |
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| Authors: | CHEN Wei LUO Liao-fu |
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