蛋白质共进化分析研究进展

一些对蛋白质活性很重要的残基在进化过程中是高度保守的,另有一些残基通过共进化来维持蛋白质结构和功能上的稳定。由于共进化残基分析可在未知蛋白质结构时,仅依据序列推断残基间的相互作用,因此在蛋白质结构和功能预测上具有重要的研究意义。当前分析共进化残基的方法主要有基于相关系数的方法、基于微扰理论的方法、参数检验法等。然而,由于存在蛋白质系统进化的背景干扰,目前共进化残基分析的精度仍有待进一步提高。本文概述了蛋白质共进化分析的方法及其研究进展,并对其发展趋势进行了预测。

Advance in Protein Coevolution Analysis

Some functionally important protein residues are highly conserved,while co-evolving residues are also able to preserve structure and function of proteins.Because protein coevolution analysis can predict residues-residues interactions from their sequences without structural information,it is very significant in protein structure and function prediction.Nowadays,protein coevolution analysis is mainly based on coefficient correlation methods,perturbation methods and parameter test.However,because of phylogenet...