人Daintain 基因5'调控区序列的生物信息学分析 |
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引用本文: | 颜冬菁,王青松,唐敏,王咸寿,冯秋芳,陈正望.人Daintain 基因5''调控区序列的生物信息学分析[J].现代生物医学进展,2015,15(21):4178-4181. |
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作者姓名: | 颜冬菁 王青松 唐敏 王咸寿 冯秋芳 陈正望 |
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作者单位: | 海南医学院理学院生化与分子生物学教研室;海南医学院理学院生物技术专业实验室;华中科技大学生命科学与技术学院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(81460558,81172511);海南医学院人才引进科研启动经费(2013005) |
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摘 要: | 目的:探讨人Daintain 基因5''调控区的序列特征。方法:利用在线软件BLAST、Neural Network Promoter Prediction、Promoter
2.0、Promoter SCAN、EMBOSS、CpG Island Searcher 和TF SEARCH预测人Daintain 基因启动子区域、CpG 岛分布和转录因子结
合位点。结果:人Daintain 基因5''调控区存在1 个CAAT盒。Daintain 基因可能存在6 个启动子位点,CpG岛可能位于216 bp 区
间( 23 ~ 238 bp)。评分85 分以上时,该序列存在251 个可能的转录因子结合位点;评分90 分以上时,该序列存在70 个可能的转
录因子结合位点;评分95 分以上时,该序列存在16个可能的转录因子结合位点;评分100 分以上时,该序列存在7 个可能的转
录因子结合位点;这些结合的转录因子基本是与免疫细胞增殖或性别发生有关。结论:人Daintain 基因5''调控区的生物信息学研
究表明其转录受甲基化和多种转录因子的调控,为研究Daintain 基因启动子的功能提供理论基础。
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关 键 词: | 人Daintain 基因 5'' 调控区 启动子 CpG岛 转录因子结合位点 |
Bioinformatics Analysis of the Human Daintain Gene 5' Regulatory Region |
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Abstract: | |
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Keywords: | |
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