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人Daintain 基因5'调控区序列的生物信息学分析
引用本文:颜冬菁,王青松,唐敏,王咸寿,冯秋芳,陈正望.人Daintain 基因5''调控区序列的生物信息学分析[J].现代生物医学进展,2015,15(21):4178-4181.
作者姓名:颜冬菁  王青松  唐敏  王咸寿  冯秋芳  陈正望
作者单位:海南医学院理学院生化与分子生物学教研室;海南医学院理学院生物技术专业实验室;华中科技大学生命科学与技术学院
基金项目:国家自然科学基金项目(81460558,81172511);海南医学院人才引进科研启动经费(2013005)
摘    要:目的:探讨人Daintain 基因5''调控区的序列特征。方法:利用在线软件BLAST、Neural Network Promoter Prediction、Promoter 2.0、Promoter SCAN、EMBOSS、CpG Island Searcher 和TF SEARCH预测人Daintain 基因启动子区域、CpG 岛分布和转录因子结 合位点。结果:人Daintain 基因5''调控区存在1 个CAAT盒。Daintain 基因可能存在6 个启动子位点,CpG岛可能位于216 bp 区 间( 23 ~ 238 bp)。评分85 分以上时,该序列存在251 个可能的转录因子结合位点;评分90 分以上时,该序列存在70 个可能的转 录因子结合位点;评分95 分以上时,该序列存在16个可能的转录因子结合位点;评分100 分以上时,该序列存在7 个可能的转 录因子结合位点;这些结合的转录因子基本是与免疫细胞增殖或性别发生有关。结论:人Daintain 基因5''调控区的生物信息学研 究表明其转录受甲基化和多种转录因子的调控,为研究Daintain 基因启动子的功能提供理论基础。

关 键 词:人Daintain  基因  5''  调控区  启动子  CpG岛  转录因子结合位点

Bioinformatics Analysis of the Human Daintain Gene 5' Regulatory Region
Abstract:
Keywords:
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