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| 基于PCR 技术的人脑基因可变剪接差异性研究 | |
| 引用本文： | 张晓宇,熊洁仪 梁洪雨,邵宁一 Philipp Khaitovich 杨洪一.基于PCR 技术的人脑基因可变剪接差异性研究[J].现代生物医学进展,2012,12(6):1013-1016. |
| 作者姓名： | 张晓宇 熊洁仪 梁洪雨 邵宁一 Philipp Khaitovich 杨洪一 |
| 作者单位： | 1. 东北林业大学生命科学学院 黑龙江 哈尔滨 150040;中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所,中国科学院计算生物学重点实验室 上海200031 2. 中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所,中国科学院计算生物学重点实验室 上海,200031 3. 东北林业大学生命科学学院 黑龙江 哈尔滨 150040 |
| 基金项目： | 中国科学院重要方向项目(KSCX2-EW-R-02-02) |
| 摘 要： | 目的:对人脑的基因可变剪接位点差异性进行分析。方法:通过RNA-Seq得到的转录组数据,分析推测出在不同年龄的7对样本的大脑前额叶皮层(prefrontal cortex,PFC)表达的某些基因具有可变剪接位点的差异性;为验证此推测,设计7对引物,提取不同年龄样本的RNA,通过反转录合成cDNA,采用PCR技术扩增目的序列。结果:在已剪接和(或)未剪接产物预期片段处有明显的条带。结论:通过Quantity One软件分析后,确定在不同年龄间存在可变剪接差异。基于PCR技术的基因可变剪接分析对RNA-seq数据集的预测结果进行验证是一种有效新颖的PCR新应用。 |
| 关 键 词： | 可变剪接 聚合酶链式反应 mRNA前体 RNA-seq 大脑前额叶皮层 |
Investigation of Difference of Alternative Splicing In Human Brain Based On PCR |
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| ZHANG Xiao-yu,XIONG Jie-yi,LIANG Hong-yu,SHAO Ning-yi,Philipp Khaitovich,YANG Hong-yi.Investigation of Difference of Alternative Splicing In Human Brain Based On PCR[J].Progress in Modern Biomedicine,2012,12(6):1013-1016. | |
| Authors: | ZHANG Xiao-yu XIONG Jie-yi LIANG Hong-yu SHAO Ning-yi Philipp Khaitovich YANG Hong-yi |
| Institution: | 1(1 College of Life Science,Northeast Forestry University,26 Hexing Road,150040,Harbin,China; 2 Key Laboratory of Computational Biology,CAS-MPG Partner Institute for Computational Biology,Chinese Academy of Sciences; 320 Yueyang Road,200031,Shanghai,China) |
| Abstract: | |
| Keywords: | Alternative splicing PCR Pre-mRNA RNA-seq Prefrontal cortex |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ | |
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