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人Boule基因启动子区结合蛋白的生物信息学分析
引用本文:陈保锋,曾梅,申跃武,章欢,梁素华,刑婷.人Boule基因启动子区结合蛋白的生物信息学分析[J].现代生物医学进展,2013(31):6184-6188,6193.
作者姓名:陈保锋  曾梅  申跃武  章欢  梁素华  刑婷
作者单位:[1]川北医学院基础医学院生物学教研室,四川南充637000 [2]哈尔滨医科大学,黑龙江哈尔滨150081
基金项目:四川省科技厅支撑计划(2011szz012);四川省教育厅资助项目(11ZB186);国家自然科学基金项目(81102278)
摘    要:目的:对精子发生RNA结合蛋白Boule基因启动子区结合蛋白进行生物信息学分析。方法:从基因参考序列数据库获取Boule基因启动子区序列,使用TFSEARCH程序对启动子序列中的转录因子结合位点进行预测。结果:成功获得长度为2kb的人Boule基因启动子区序列。该启动子区Thresholdscore〉90的共有60个转录因子结合位点,涉及sox家族、GATA结合蛋白家族、热休克因子家族、锌指蛋白Kruppel家族、POU家族、runt家族、同源异型框基因家族、TALE类同源结构蛋白家族、转录因子螺旋环螺旋家族、IKAROS家族、FOX家族11个家族的转录因子和3个TATAbox。结论:Boule基因表达的调控是在一定时间或空间上、一种或多种调节蛋白作用的复杂过程。调控Boule基因表达的转录因子绝大部分与胚胎发育、性别决定、个体生长密切相关。

关 键 词:Boule基因  启动子  转录因子

Bioinformatic Analysis of Human Boule Hromoter Binding Proteins
CHEN Bao-feng,ZENG Mei,SHEN Yue-wu,ZHANG Huan,LIANG Su-hua,XING Ting.Bioinformatic Analysis of Human Boule Hromoter Binding Proteins[J].Progress in Modern Biomedicine,2013(31):6184-6188,6193.
Authors:CHEN Bao-feng  ZENG Mei  SHEN Yue-wu  ZHANG Huan  LIANG Su-hua  XING Ting
Institution:1 Department of Medical Biology, Noah Sichuan Medical College, Nanchong, Sichuan, 637000, China; 2 Harbin Methcal University, Harbin, Heilongjiang, 150081, China)
Abstract:
Keywords:
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