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PAX3 基因及其蛋白的生物信息学分析
引用本文:张敏权力张霆.PAX3 基因及其蛋白的生物信息学分析[J].现代生物医学进展,2011,11(1):36-40.
作者姓名:张敏权力张霆
作者单位:北京大学首都儿科研究所教学医院,北京,100020
基金项目:首都医学发展科研基金资助项目(2005-2048); 国家自然科学基金资助项目(20905051)
摘    要:目的:对PAX3基因和PAX3蛋白进行生物信息学分析,更多的了解该基因的相关信息,为进一步研究PAX3与神经管畸形的相关性研究提供基础。方法:运用生物信息学方法对PAX3基因的基因结构、单核苷酸多态性位点(SNP)、PAX3基因与其他基因的相互作用网络、PAX3蛋白结构域、蛋白二级结构、蛋白间相互作用网络、以及PAX3蛋白所调控和影响的靶基因进行分析。结果:PAX3基因有9中可变剪切形式,编码区存在14个SNP位点,其中错意突变13个,移码突变1个。PAX3蛋白由479个氨基酸组成,分子量52968Da,PAX3蛋白可能调控和影响151个靶基因的转录和表达,与PAX3基因存在相互作用的基因和与PAX3蛋白存在相互作用的蛋白多数与发育相关。结论:通过对PAX3基因和PAX3蛋白的生物信息学分析获得了其相应的分子生物学特征,为进一步研究提供基础。

关 键 词:PAX3基因  生物信息学  转录因子  神经管畸形

Bioinformatic analysis of PAX3 gene and PAX3 protein
ZHANG Min,QUAN Li,ZHANG Ting.Bioinformatic analysis of PAX3 gene and PAX3 protein[J].Progress in Modern Biomedicine,2011,11(1):36-40.
Authors:ZHANG Min  QUAN Li  ZHANG Ting
Institution:△(Peking University Teaching Hospital-Capital Institute of Pediatrics,Beijing,100020,China)
Abstract:
Keywords:
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