| 伤寒沙门菌非编码RNA617的分子鉴定及其对生物膜形成的影响研究 |
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| 引用本文： | 靳梦彤,李雪,党娟娟,李泽宇,张盈,黄新祥.伤寒沙门菌非编码RNA617的分子鉴定及其对生物膜形成的影响研究[J].微生物与感染,2022,17(1):18-29. |
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| 作者姓名： | 靳梦彤 李雪 党娟娟 李泽宇 张盈 黄新祥 |
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| 作者单位： | 1. 江苏大学医学院生物化学与分子生物学系，江苏 镇江 212013; 2. 南通市第三人民医院检验科，江苏 南通 226006 |
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| 基金项目： | 中国博士后科学基金资助项目(2018M642186)；江苏省高等学校自然科学研究重大项目 (20KJA310006)；江苏大学青年英才培育计划 |
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| 摘 要： | 本研究旨在探讨伤寒沙门菌(Salmonella enterica serovar Typhi, S. Typhi)中非编码RNA617(non-coding RNA617，ncRNA617)的分子特性，并研究其对生物膜形成的影响及作用机制。采用Northern blot方法检测ncRNA617的表达，通过cDNA 5’末端快速扩增技术(5’-rapid amplification of cDNA end，5’RACE)和逆转录-聚合酶链式反应(reverse transcriotion-polymerase chain reaction，3’RT-PCR)实验分析ncRNA617可能的转录起始位点和终止位点；构建ncRNA617缺陷菌株、回补菌株和过表达菌株等相关菌株，通过生物膜形成实验，观察ncRNA617对伤寒沙门菌生物膜形成的影响，并用实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real-time polymerase chain reaction，qPCR)分析生物膜形成相关基因表达水平的变化，综合运用生物信息学方法预测ncRNA617和差异基因的结合区域，初步分析ncRNA617发挥调控作用的机制。结果显示，伤寒沙门菌确有ncRNA617的表达，长度约300 nt，其转录起始位点位于mig-14终止密码子下游967 nt处，终止位点位于t2681起始密码子上游 2 378～2 560 nt处。与野生对照菌株相比，ncRNA617缺陷菌株生物膜形成能力增强(P<0.05)，回补菌株的生物膜形成能力恢复至野生菌株水平，过表达菌株的生物膜形成能力有所下降(P<0.05)。qPCR结果表明，ncRNA617可负向调控多个生物膜形成相关基因的转录表达水平(P<0.05)。经生物信息学方法预测发现，ncRNA617与差异基因有不同的结合区域。本研究结果提示，ncRNA617在伤寒沙门菌中存在，其长度约270～452 nt。ncRNA617可能通过靶向结合生物膜形成相关基因下调基因表达，从而负向调控伤寒沙门菌生物膜的生成。
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| 关 键 词： | 伤寒沙门菌 分子鉴定 非编码RNA 生物膜 |
Molecular identification of Salmonella enterica serovar Typhi ncRNA617 and its effect on biofilm formation |
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| JIN Mengtong,LI Xue,DANG Juanjuan,LI Zeyu,ZHANG Ying,HUANG Xinxiang.Molecular identification of Salmonella enterica serovar Typhi ncRNA617 and its effect on biofilm formation[J].Journal of Microbes and Infection,2022,17(1):18-29. |
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| Authors: | JIN Mengtong LI Xue DANG Juanjuan LI Zeyu ZHANG Ying HUANG Xinxiang |
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| Institution: | 1. Department of Biochemistry and Molecular Biology, School of Medicine, Jiangsu University, Zhenjiang 212013, Jiangsu Province, China; 2. Department of Clinical Laboratory, the Affiliated Nantong Third Hospital of Nantong University, Nantong 226006, Jiangsu Province, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Salmonella enterica serovar Typhi Molecular identification Non-coding RNA Biofilm |
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