首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
   检索      

家蚕神经肽基因的筛查及成熟肽的预测
引用本文:甘玲,梁九波,刘喜龙,何宁佳.家蚕神经肽基因的筛查及成熟肽的预测[J].昆虫学报,2010,53(1):9-19.
作者姓名:甘玲  梁九波  刘喜龙  何宁佳
作者单位:西南大学蚕学与系统生物学研究所,农业部蚕桑学重点开放实验室,重庆,400716
基金项目:国家高技术研究发展计划(“863”计划)项目(2006AA10A118)
摘    要:神经肽(neuropeptide)是家蚕Bombyx mori体内重要的调控物质。为了充分理解神经肽对家蚕发育的调控, 扩充家蚕神经肽的数量, 本研究利用BLAST的tblastn程序结合OpenOffice软件的查找程序, 基于其他昆虫和无脊椎动物神经肽的同源性和保守的结构特点, 在家蚕基因、理论蛋白质数据库及NCBI中进行全面而系统的基因筛查; 并利用各种在线工具对所筛查到基因和理论蛋白质的结构和成熟肽进行预测分析。结果共获得allatostatin-A (AST-A), allatostatin-B (AST-B), allatostatin-C (AST-C), allatropin (AT), ecdysis-triggering hormone (ETH), crustacean cardioactive peptide (CCAP)和FMRFamide等31个神经肽基因家族, 包括37个神经肽基因亚家族, 共计44个神经肽基因; 预测出193个成熟的神经肽, 其中73个根据家族同源性预测在C末端发生酰胺化, 而6个被预测在N末端发生了环化, 9个被预测酪氨酸发生了硫酸化。大部分成熟神经肽都具有明显的家族结构特征, 但proctolin, CCAP及CAPA-PK成熟肽结构上与其他昆虫相比有所扩展。结果提示, 家蚕神经和内分泌细胞产生了几乎在所有昆虫中具有的神经肽前体; 进化过程中大部分成熟神经肽的氨基酸序列在种间产生了差异, 但家族特征性基序高度保守。本研究为神经肽功能研究以及神经肽对家蚕发育尤其是蛹期发育调控的研究奠定了基础。

关 键 词:家蚕  神经肽  基因筛查  成熟肽  酰胺化  环化  硫酸化  信息分析  

Neuropeptide gene screening and mature peptide prediction in the silkworm,Bombyx mori
GAN Ling,LIANG Jiu-Bo,LIU Xi-Long,HE Ning-Jia.Neuropeptide gene screening and mature peptide prediction in the silkworm,Bombyx mori[J].Acta Entomologica Sinica,2010,53(1):9-19.
Authors:GAN Ling  LIANG Jiu-Bo  LIU Xi-Long  HE Ning-Jia
Institution:Key Sericulture Laboratory of the Ministry of Agriculture/a>;Institute of Sericulture and Systems Biology/a>;Southwest University/a>;Chongqing 400716/a>;China
Abstract:Neuropeptides play an important role of regulation for the silkworm,Bombyx mori. To fully comprehend the regulation of neuropeptides in the growth of B. mori and to get more neuropeptides in B. mori,the online program tblastn of BLAST and the search program of OpenOffice software were used to screen genes encoding putative neuropeptide precursors in the databases of silkworm genome and theoretical proteins based on the homology and the structure of the neuropeptides conserved in other insects and invertebra...
Keywords:Bombyx mori  neuropeptide  gene screening  mature peptide  amidation  cyclization  sulfation  information analysis  
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
点击此处可从《昆虫学报》浏览原始摘要信息
点击此处可从《昆虫学报》下载免费的PDF全文
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号