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RAD-seq技术及其在昆虫学研究中的应用
引用本文:魏书军,李冰艳,曹利军,朱家颖.RAD-seq技术及其在昆虫学研究中的应用[J].昆虫学报,2016(7):767-774.
作者姓名:魏书军  李冰艳  曹利军  朱家颖
作者单位:1. 北京市农林科学院植物保护环境保护研究所,北京,100097;2. 北京市农林科学院植物保护环境保护研究所,北京100097;西南林业大学,云南省森林灾害预警与控制重点实验室,昆明650224;3. 西南林业大学,云南省森林灾害预警与控制重点实验室,昆明650224
基金项目:北京市自然科学基金项目(6162010),国家自然科学基金项目(31472025),国家重点基础研究发展计划项目(2013CB127600)
摘    要:限制性酶切位点关联DNA测序技术(restriction-site-associated DNA sequencing,RAD-seq)是在二代测序技术基础上发展起来的一种简化基因组技术(reduced-representation genome sequencing,RRGS)。RAD-seq利用限性核酸内切酶使基因组片段化,经过修饰后连接含标记的接头构建文库并进行测序。因其具有操作简单、实验成本低、通量高等优点,在分子生态学、进化基因组学、保护遗传学等领域得到应用。目前发展起来的RAD-seq技术主要包括利用稀有酶和物理打断方式进行基因组片段化的mbRAD、利用稀有酶和常见酶组合酶切的方式进行基因组片段化的ddRAD、利用IIB型限制性内切酶得到短片段文库的2bRAD、利用同裂酶和Illumina试剂盒建库的ezRAD和完全利用Nextera试剂盒建库的nextRAD。本文对每种RAD-seq技术的特点及其在昆虫种群遗传学、群落生态学、物种界定、系统发育和遗传连锁图谱构建等研究领域的应用进行了综述。

关 键 词:RAD-seq  昆虫学  种群遗传学  物种界定  系统发育  遗传连锁图谱

RAD-seq and its application in entomological research
Abstract:
Keywords:RAD-seq  entomology  population genetics  species delimitation  phylogeny  genetic linkage map
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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