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基于线粒体COⅠ基因的齿小蠹属昆虫DNA条形码研究
引用本文:常虹,郝德君,肖荣堂,刘勇,钱路,安榆林,杨晓军.基于线粒体COⅠ基因的齿小蠹属昆虫DNA条形码研究[J].昆虫学报,2012,55(9):1075-1081.
作者姓名:常虹  郝德君  肖荣堂  刘勇  钱路  安榆林  杨晓军
作者单位:1. 南京林业大学森林资源与环境学院,南京,2100372
2. 吴江出入境检验检疫局,江苏吴江,2152003
3. 江苏出入境检验检疫局,南京,210001
基金项目:科技部国际科技合作项目(2009DFA31950);国家质检总局项目(2010IK256);国家科技支撑计划课题(2012BAK11B03)
摘    要:齿小蠹属(鞘翅目: 小蠹科)昆虫是植物检疫中经常截获的类群, 为探讨线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因的特定区段作为DNA条形码快速准确鉴定齿小蠹种类的可行性, 以齿小蠹属昆虫为研究对象, 测定分析了线粒体COⅠ基因462 bp碱基序列。序列分析结果显示: 变异位点为259个, 保守位点203个, 简约信息位点181个, 自裔位点78个。所有位点中, A, G, C和T碱基平均含量分别为30.7%, 16.5%, 17.0%和35.8%。A+T含量较高, 为66.5%, 明显高于G+C含量, 表现明显的A+T碱基偏嗜, 且A与T含量相当, 符合昆虫线粒体基因碱基组成的基本特征。转换与颠换结果显示: 该段序列未达到饱和, 可以得到准确的进化分析。利用Kimura 2-parameter模型分析遗传距离得到, 同物种间的遗传距离介于0.002~0.007之间, 不同种间的遗传距离介于0.056~0.431间, 平均遗传距离为0.199, 说明该段序列能够区分不同物种。基于COⅠ基因序列构建的邻接法系统发育树(NJ树)显示, 同一物种聚为同一小支, 且分支自展值均为100%; 近缘种能聚集在一起, 且置信度很高(≥97%)。结果表明应用基于COⅠ基因片段的DNA条形码进行齿小蠹属昆虫分类鉴定具有可行性。

关 键 词:齿小蠹属    DNA条形码    线粒体COⅠ基因    遗传距离    系统发育树  
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