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大卫绢蛱蝶线粒体基因组全序列测定和分析
引用本文:夏靖,胡静,朱国萍,朱朝东,郝家胜.大卫绢蛱蝶线粒体基因组全序列测定和分析[J].昆虫学报,2011,54(5):555-565.
作者姓名:夏靖  胡静  朱国萍  朱朝东  郝家胜
作者单位:1. 安徽师范大学生命科学学院,安徽芜湖,241000
2. 安徽师范大学生命科学学院,安徽芜湖241000;中国科学院动物研究所动物进化与系统学重点实验室,北京100101
3. 中国科学院动物研究所动物进化与系统学重点实验室,北京,100101
基金项目:安徽省高校省级自然科学研究重点项目,安徽省优秀青年科技基金,安徽省"重要生物资源保护与利用"重点实验室及中青年学术与技术带头人专项基金,北京市自然科学基金重点项目
摘    要: 目前有关蝶类线粒体基因组全序列及其分子进化的研究报道还不多见。本文利用long PCR和引物步移法得到大卫绢蛱蝶Calinaga davidis的线粒体基因组全序列, 同时就其基因组成和结构特点作了初步分析。结果显示: 其基因组全长为15 267 bp (GenBank登录号为HQ658143), 包括13个蛋白质编码基因(ATP6, ATP8, COI-III, ND1-6, ND4L, Cytb)、22个tRNA基因、2个rRNA基因(16S和12S)以及非编码的控制区。与其他鳞翅目昆虫相一致, 其基因组未出现基因重排现象。基因组共包含11个基因间隔区,总长度为130 bp, 间隔长度1~46 bp, 最大间隔在tRNAGln与ND2基因之间; 基因间共存在13处重叠, 总长度为66 bp, 重叠碱基数1~35 bp, 最长的重叠区位于COII与tRNALys基因。lrRNA和srRNA基因长度分别为1 337 bp和773 bp; 除tRNASer(AGN)缺少二氢尿嘧啶臂(DHU stem), 在相应的位置上只形成一个简单环外, 其余的tRNA基因都能形成典型的三叶草结构。13个蛋白编码基因总长度为11 247 bp, 共有3 737个密码子, 它们的碱基组成和密码子的使用具有明显的偏倚性; 除COI外(起始密码子TTG), 其余的12个蛋白质编码基因都以标准的ATN作为起始密码子; COI基因终止密码子为不完全T, ND4基因终止密码子为不完全TA, 其余基因都以TAA为终止密码子。A+T丰富区全长为389 bp, A+T含量高达92.0%, 其中存在2段类似微卫星的重复序列(TA)6和(AAT)4。本文的研究结果为探讨绢蛱蝶亚科在蛱蝶科中的系统学地位及其与其他亚科间的系统发生关系等问题提供了重要的分子生物学数据。

关 键 词:鳞翅目    大卫绢蛱蝶    线粒体基因组    tRNA  二级结构    串联重复序列
收稿时间:2010-12-07;

Sequencing and analysis of the complete mitochondrial genome of Calinaga davidis Oberthür ( Lepidoptera: Nymphalidae)
XIA Jing,HU Jing,ZHU Guo-Ping,ZHU Chao-Dong,HAO Jia-Sheng.Sequencing and analysis of the complete mitochondrial genome of Calinaga davidis Oberthür ( Lepidoptera: Nymphalidae)[J].Acta Entomologica Sinica,2011,54(5):555-565.
Authors:XIA Jing  HU Jing  ZHU Guo-Ping  ZHU Chao-Dong  HAO Jia-Sheng
Institution:XIA Jing1,HU Jing1,2,ZHU Guo-Ping1,ZHU Chao-Dong2,HAO Jia-Sheng1(1.College of Life Sciences,Anhui Normal University,Wuhu,Anhui 241000,China,2.Key Laboratory of Zoological Systematics and Evolution,Institute of Zoology,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100101,China)
Abstract:Up to now,the reports about the complete mitochondrial genome of butterflies and their corresponding molecular evolutions are still limited.In this paper,the complete mitochondrial genome(mitogenome) of Calinaga davidis was sequenced and analyzed using the long PCR and the conserved primer walking technology.The results showed that the entire mitochondrial genome sequence was 15 267 bp long(GenBank accession no.HQ658143),containing 13 protein-coding genes(ATP6,ATP8,COI-III,ND1-6,ND4L and Cytb),22 transfer R...
Keywords:Lepidoptera  Calinaga davidis  mitochondrial genome  tRNA secondary structure  tandemly repeated sequences  
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