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白桦HD-Zip基因家族生物信息学及应答盐胁迫分析
引用本文:王家啟,张曦,李莉. 白桦HD-Zip基因家族生物信息学及应答盐胁迫分析[J]. 植物研究, 2018, 38(6): 931-938. DOI: 10.7525/j.issn.1673-5102.2018.06.017
作者姓名:王家啟  张曦  李莉
作者单位:东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室, 哈尔滨 150040
基金项目:国家自然科学基金(31470676)
摘    要:
HD-Zip转录因子蛋白家族是植物特有的一类转录因子蛋白,在植物生长发育和抵抗逆境胁迫等过程中发挥着重要作用。利用白桦全基因组数据库,获得白桦35条HD-Zip蛋白序列,参考拟南芥中该家族的分类方法,将这些成员分成HD-ZipⅠ-Ⅳ四个亚家族,并对这些成员的蛋白保守结构域、氨基酸组成、染色体分布、和理化性质等进行了预测和分析。从高盐处理的白桦幼苗根组织的转录组数据,鉴定了7个差异表达的基因。本研究为进一步研究白桦HD-Zip家族基因调控白桦耐盐性的功能提供了理论支持。

关 键 词:白桦  HD-Zip  基因家族  生物信息学分析  
收稿时间:2018-06-19

Bioinformatic and Expression Analysis of HD-Zip Family Gene in Betula platyphylla
WANG Jia-Qi,ZHANG Xi,LI Li. Bioinformatic and Expression Analysis of HD-Zip Family Gene in Betula platyphylla[J]. Bulletin of Botanical Research, 2018, 38(6): 931-938. DOI: 10.7525/j.issn.1673-5102.2018.06.017
Authors:WANG Jia-Qi  ZHANG Xi  LI Li
Affiliation:State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding, Northeast Forestry University, Harbin 150040
Abstract:
Keywords:Betula platyphylla Suk.  HD-Zip  gene family  bioinformatic analysis  
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