| 新型冠状病毒序列变异时空分析系统的设计与实现 |
| |
| 引用本文： | 李建勋,李鑫,谢康,徐德晨,李杰.新型冠状病毒序列变异时空分析系统的设计与实现[J].生物信息学,2020,18(2):86-95. |
| |
| 作者姓名： | 李建勋 李鑫 谢康 徐德晨 李杰 |
| |
| 作者单位： | 哈尔滨工业大学 计算机科学与技术学院 生物信息学研究中心,哈尔滨 150001 |
| |
| 基金项目： | 国家精准医学研究重点研发专项(No.2016YFC905);哈尔滨工业大学新型冠状病毒肺炎疫情应急科研攻关项目. |
| |
| 摘 要： | 新型冠状病毒肺炎目前已进入全球大流行状态,多个国家出现疫情爆发。美国疾病管制局期刊《新兴传染病》发表的关于新型冠状病毒的最新研究结论显示,新型冠状病毒基本传染数R0的中位数高达5.7,这意味着在未来较长时间内新型冠状病毒可能会在人群中持续传播并发生变异。在这一背景下,如何监视病毒的变异,对于冠状病毒的研究和药物研发具有重要意义。本文基于来自GISAID的病毒基因组序列数据,设计和实现了新型冠状病毒变异时空分析系统。该系统可对来自不同国家和地区的新型冠状病毒序列数进行统计,对病毒序列在不同时间、不同空间内的变异情况进行分析和可视化,同时还支持不同序列之间的差异比对。该系统可为新型冠状病毒肺炎的研究和政府的疾病控制机构的决策提供支持。
|
| 关 键 词： | 新型冠状病毒 新型冠状病毒肺炎 时空变异分析 |
| 收稿时间： | 2020/4/23 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2020/4/30 0:00:00 |
Design and implementation of SARS-CoV-2 variation spatio-temporal analysis system |
| |
| LI Jianxun,LI Xin,XIE Kang,XU Dechen,LI Jie.Design and implementation of SARS-CoV-2 variation spatio-temporal analysis system[J].China Journal of Bioinformation,2020,18(2):86-95. |
| |
| Authors: | LI Jianxun LI Xin XIE Kang XU Dechen LI Jie |
| |
| Institution: | Bioinformatics Research Center, School of Computer Science and Technology, Harbin Institute of Technology,Harbin 150001,China |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | SARS-CoV-2 COVID-19 Spatio-temporal variation analysis |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《生物信息学》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《生物信息学》下载免费的PDF全文 |
|
