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草鱼过氧化氢酶全长cDNA的克隆、序列同源分析与组织表达
引用本文:郑清梅,韩春艳,温茹淑,钟艳梅,姚琼凤,侯雨文.草鱼过氧化氢酶全长cDNA的克隆、序列同源分析与组织表达[J].基因组学与应用生物学,2011,30(5).
作者姓名:郑清梅  韩春艳  温茹淑  钟艳梅  姚琼凤  侯雨文
作者单位:嘉应学院生命科学学院,梅州,514015
基金项目:广东高校优秀青年创新人才培育项目,广东省自然科学基金
摘    要:过氧化氢酶(catalase,CAT)是生物体内抗氧化防御系统的关键酶之一,在清除过氧化氢而避免机体产生氧化应激的过程中起重要作用.本研究从草鱼(Ctenopharyngodon idellus)肝胰脏中克隆了CAT完整编码序列(complete coding sequence,CDS).该CAT序列(GenBank登陆号:FJ560431)全长2 263 bp,包括完全开放阅读框(ORF) 1 575 bp、5'非编码区(UTR) 118 bp和3' UTR 570 bp.其ORF编码525个氨基酸残基,理论分子量为59.59 kD,等电点为7.02.在草鱼CAT cDNA的终止密码子附近,其3' UTR具有长且完整的AC重复序列,与斑马鱼、鲢鱼及啮齿类动物CAT的3' UTR AC重复序列相似.序列比较表明,草鱼CAT的核苷酸及推测氨基酸序列与其它多种物种的一致性均较高,其一致性分别为93.4%~43.0%和98.1%~63.3%.同时,草鱼CAT cDNA的推测氨基酸序列具有与其它动物高度保守的特征性基序,包括亚铁血红素结合信号序列"RLFSYPDTH"、酶活性中心序列"FDRERIPERVVHAKGA"及3个催化位点残基His74、Asn147和Tyr357.此外,草鱼CAT还具有保守的亚铁血红素结合口袋与NADPH 结合位点.根据草鱼CAT基因的上述特征,推测其属于CAT基因家族中的单功能或典型CAT基因亚群.采用实时荧光定量PCR (Q-PCR)检测草鱼CAT的组织表达特征.结果显示,草鱼CAT mRNA在所检测的11种组织器官中均有表达,其中在肝中表达水平量较高,在红肌、白肌和脂肪中表达量较低.本研究结果将有助于进一步探讨鱼类CAT基因的结构与功能,并为研究其抗氧化分子机理奠定基础.

关 键 词:草鱼  过氧化氢酶  克隆  序列分析  组织表达

Full-length cDNA Cloning, Sequence Homology Analysis and Tissue Expre-ssion of a Catalase Gene from Grass Carp (Ctenopharyngodon idellus)
Zheng Qingmei,Han Chunyan,Wen Rushu,Zhong Yanmei,Yao Qiongfeng,Hou Yuwen.Full-length cDNA Cloning, Sequence Homology Analysis and Tissue Expre-ssion of a Catalase Gene from Grass Carp (Ctenopharyngodon idellus)[J].Genomics and Applied Biology,2011,30(5).
Authors:Zheng Qingmei  Han Chunyan  Wen Rushu  Zhong Yanmei  Yao Qiongfeng  Hou Yuwen
Abstract:
Keywords:
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