| 布渣叶糖基转移酶MpUGT1基因cDNA克隆及生物信息学和表达分析 |
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| 引用本文： | 张初梅,何卓儒,林爽,潘天玲,袁旭江,李坤平. 布渣叶糖基转移酶MpUGT1基因cDNA克隆及生物信息学和表达分析[J]. 基因组学与应用生物学, 2019, 38(5): 2137-2143 |
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| 作者姓名： | 张初梅 何卓儒 林爽 潘天玲 袁旭江 李坤平 |
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| 作者单位： | 广东药科大学药学院,广州,510006;广东药科大学,中药开发研究所,广州,510006 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金;广东省科技计划 |
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| 摘 要： | UGT催化的糖基转移反应对合成黄酮苷类至关重要。为探究影响布渣叶黄酮苷生物合成的糖基转移酶,本研究参考布渣叶转录组数据,设计特异性引物,采用RT-PCR法对布渣叶中的UDP-葡萄糖基转移酶(UDP-glucosyltransferase, UGT)基因MpUGT1的编码区进行克隆,并通过在线服务器分析该基因的生物信息学特性;利用实时荧光定量PCR方法检测了MpUGT1基因在布渣叶的芽、叶、枝、果、花不同部位的表达情况。结果表明,本研究克隆得到的布渣叶MpUGT1基因,其cDNA全长为1 397 bp,ORF 1 377 bp,编码458个氨基酸,GenBank登陆号为KY652922。生物信息学预测分析该基因编码蛋白质分子式为C2324H3643N603O671S18,相对分子质量为51 kD,理论等电点(PI)为5.99,不稳定系数为43.81,亲水性系数为-0.105。该蛋白没有跨膜结构域,含有UDP-葡萄糖醛酸/UDP-葡萄糖基转移酶家族保守结构域,不含信号肽,定位于叶绿体。RT-qPCR组织特异性表达分析结果表明MpUGT1在芽、叶、枝、果、花中均有表达,且叶的表达量最高。系统进化树分析显示Mp UGT1与同科植物黄麻、长蒴黄麻等同源UGT的相似度最高,均达到了约80%;上述结果为进一步研究该基因在布渣叶黄酮苷生物合成中的作用奠定了基础。
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| 关 键 词： | 布渣叶 糖基转移酶基因(UGT) 黄酮苷 基因克隆 生物信息学分析 |
Cloning,Bioinformatics and Expression Analysis of UDP-Glucosyl-Transferase Gene MpUGT1 in Microcos paniculata Linn |
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| Zhang Chumei,He Zhuoru,Lin Shuang,Pan Tianling,Yuan Xujiang,Li Kunping. Cloning,Bioinformatics and Expression Analysis of UDP-Glucosyl-Transferase Gene MpUGT1 in Microcos paniculata Linn[J]. Genomics and Applied Biology, 2019, 38(5): 2137-2143 |
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| Authors: | Zhang Chumei He Zhuoru Lin Shuang Pan Tianling Yuan Xujiang Li Kunping |
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| Affiliation: | (School of Pharmacy, Guangdong Pharmaceutical University, Guangzhou, 510006;Research & Development Institute of Chinese Materia, GuangdongPharmaceutical University, Guangzhou, 510006) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Microcos paniculata Linn UDP-glycosyltransferase gene(UGT) Flavone glycoside Gene cloning Bioinformatic analysis |
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