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秧鸡科部分鸟类线粒体基因组的比较及系统发育关系分析
引用本文:徐小蓉,何诗远,张明明,粟海军,熊勇,王野影.秧鸡科部分鸟类线粒体基因组的比较及系统发育关系分析[J].基因组学与应用生物学,2019(9).
作者姓名:徐小蓉  何诗远  张明明  粟海军  熊勇  王野影
作者单位:贵州师范大学生命科学学院植物生理与发育调控重点实验室;贵州大学生物多样性与自然保护研究中心
摘    要:秧鸡科鸟类的系统发育关系尚不明确,本研究通过对秧鸡科11属共17种鸟类的线粒体基因组中各基因进行变异位点和简约信息位点分析。选取变异位点和简约信息位点含量均较高的CR、ND2、ND4、ND5及线粒体基因组分别作为分子标记,采用NJ法、ML法和贝叶斯法分别构建系统发育树。通过对各系统树进行比较分析,结果表明:红胸田鸡、小田鸡、紫水鸡、南秧鸡、黑水鸡、白骨顶鸡、新西兰秧鸡、粟腹秧鸡、红眼斑秧鸡、冲绳秧鸡和奥岛秧鸡的系统发育关系明确;考虑将董鸡属划入苦恶鸟属、粟腹秧鸡划入到纹秧鸡属;支持侏秧鸡科独立成科;完整的线粒体基因组是解决秧鸡科鸟类系统发育关系的最优分子标记。研究结果将为后续增加种属,进一步解决秧鸡科鸟类的系统发育关系提供指导。

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