| 向日葵AGO和DCL基因家族的鉴定和表达分析 |
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| 作者姓名： | 张红 员世宇 王文浩 刘文俊 何丽芬 闫玉星 王彦尊 王鹏冬 郑洪元 张鑫 |
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| 作者单位： | 山西农业大学经济作物研究所, 太原 030031;山西农业大学经济作物研究所, 太原 030031;省部共建有机旱作农业国家重点实验室(筹), 太原 030031 |
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| 基金项目： | 山西省重点研发计划项目(201903D221088);国家特色油料产业技术体系项目(CARS-14-2-05);山西农业大学生物育种工程项目(YZGC047);山西省现代农业产业技术体系建设专项资金(2022-05)资助 |
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| 摘 要： | 为了解向日葵(Helianthus annuus)的Argonaute (AGO)和Dicer-like (DCL)的功能,利用拟南芥(Arabidopsis thaliana)的AGO和DCL基因序列在向日葵基因组数据库中进行同源比对,对向日葵AGO和DCL家族成员进行生物信息学分析。结果表明,从向日葵中鉴定到15个Ha AGOs和5个HaDCLs家族成员;这2类基因在染色体上的分布均不均匀。系统发育分析表明,与拟南芥相似,HaAGO家族成员可分为3个分支,HaDCL可分为4个分支;所有的HaAGO都具有保守的N domain、DUF1785、PAZ和PIWI结构域,Ha DCL家族成员都含有PAZ和RIBOc结构域。表达分析表明,Ha DCL3a和Ha DCL3b在茎和花序中高度表达;亚细胞定位表明Ha AGO多定位于细胞核。这表明向日葵中可能存在典型的RNAi干扰机制,并可能参与了协调向日葵的生长发育过程。
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| 关 键 词： | RNA干扰 AGO家族 DCL家族 向日葵 基因表达 |
| 收稿时间： | 2022-01-17 |
| 修稿时间： | 2022-05-02 |
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