| 向日葵AGO和DCL基因家族的鉴定和表达分析 |
| |
| 引用本文： | 张红,员世宇,王文浩,刘文俊,何丽芬,闫玉星,王彦尊,王鹏冬,郑洪元,张鑫.向日葵AGO和DCL基因家族的鉴定和表达分析[J].热带亚热带植物学报,2023,31(3):363-372. |
| |
| 作者姓名： | 张红 员世宇 王文浩 刘文俊 何丽芬 闫玉星 王彦尊 王鹏冬 郑洪元 张鑫 |
| |
| 作者单位： | 山西农业大学经济作物研究所, 太原 030031;山西农业大学经济作物研究所, 太原 030031;省部共建有机旱作农业国家重点实验室(筹), 太原 030031 |
| |
| 基金项目： | 山西省重点研发计划项目(201903D221088)；国家特色油料产业技术体系项目(CARS-14-2-05)；山西农业大学生物育种工程项目(YZGC047)；山西省现代农业产业技术体系建设专项资金(2022-05)资助 |
| |
| 摘 要： | 为了解向日葵(Helianthus annuus)的Argonaute (AGO)和Dicer-like (DCL)的功能，利用拟南芥(Arabidopsis thaliana)的AGO和DCL基因序列在向日葵基因组数据库中进行同源比对，对向日葵AGO和DCL家族成员进行生物信息学分析。结果表明，从向日葵中鉴定到15个Ha AGOs和5个HaDCLs家族成员；这2类基因在染色体上的分布均不均匀。系统发育分析表明，与拟南芥相似，HaAGO家族成员可分为3个分支，HaDCL可分为4个分支；所有的HaAGO都具有保守的N domain、DUF1785、PAZ和PIWI结构域，Ha DCL家族成员都含有PAZ和RIBOc结构域。表达分析表明，Ha DCL3a和Ha DCL3b在茎和花序中高度表达；亚细胞定位表明Ha AGO多定位于细胞核。这表明向日葵中可能存在典型的RNAi干扰机制，并可能参与了协调向日葵的生长发育过程。
|
| 关 键 词： | RNA干扰 AGO家族 DCL家族 向日葵 基因表达 |
| 收稿时间： | 2022/1/17 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2022/5/2 0:00:00 |
Identification and Expression Analysis of AGO and DCL Gene Families in Sunflower |
| |
| ZHANG Hong,YUAN Shiyu,WANG Wenhao,LIU Wenjun,HE Lifen,YAN Yuxing,WANG Yanzun,WANG Pengdong,ZHENG Hongyuan,ZHANG Xin.Identification and Expression Analysis of AGO and DCL Gene Families in Sunflower[J].Journal of Tropical and Subtropical Botany,2023,31(3):363-372. |
| |
| Authors: | ZHANG Hong YUAN Shiyu WANG Wenhao LIU Wenjun HE Lifen YAN Yuxing WANG Yanzun WANG Pengdong ZHENG Hongyuan ZHANG Xin |
| |
| Institution: | Institute of Industrial Crops, Shanxi Agricultural University, Taiyuan 030031, China; Institute of Industrial Crops, Shanxi Agricultural University, Taiyuan 030031, China;State Key Laboratory of Sustainable Dryland Agriculture (in preparation), Taiyuan 030031, China |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | RNAi AGO DCL Helianthus annuus Gene expression |
|
| 点击此处可从《热带亚热带植物学报》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《热带亚热带植物学报》下载免费的PDF全文 |
|
