番茄SlDP1基因的克隆、生物信息学及表达特性分析

DP基因属于DP/E2F转录因子家族;其编码的蛋白是E2F蛋白的二聚化分子伴侣;可能参与调控细胞周期、DNA复制、生长、分化、凋亡等多种细胞进程。根据SGN数据库登录的番茄序列;通过RT-PCR方法从野生型番茄中克隆了一个DP基因;命名为SlDP1。生物信息学预测;SlDP1蛋白定位于细胞核;具有保守的DNA结合域、二聚化区域和C-末端及多个磷酸化位点。蛋白质二级结构预测SlDP1蛋白含51.50%的环状结构;34.55%的α螺旋和2.66%的β折叠。荧光定量PCR分析外源激素对野生型番茄SlDP1基因表达量的影响;发现该基因受外源性乙烯前体ACC的诱导。对环境因子应答的RT-PCR结果表明;在伤害和盐处理的叶中该基因表达不受诱导;而盐处理的根中该基因表达量提高。SlDP1基因表达模式分析表明;该基因在根、花、萼片及成熟时期果实中表达量较高。这些结果为进一步研究SlDP1基因在番茄生长发育过程的功能奠定了基础。