de novo转录组学分析华南地区入侵植物五爪金龙代谢特征 |
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引用本文: | 耿妍,陈玲玲,鲁焕,宁婵娟,BJRN Lars Olof,李韶山.de novo转录组学分析华南地区入侵植物五爪金龙代谢特征[J].热带亚热带植物学报,2016,24(2):128-142. |
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作者姓名: | 耿妍 陈玲玲 鲁焕 宁婵娟 BJRN Lars Olof 李韶山 |
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作者单位: | 华南师范大学生命科学学院, 广东省高校生态学与环境科学重点实验室, 广州 510631,华南师范大学生命科学学院, 广东省高校生态学与环境科学重点实验室, 广州 510631,华南师范大学生命科学学院, 广东省高校生态学与环境科学重点实验室, 广州 510631,华南师范大学生命科学学院, 广东省高校生态学与环境科学重点实验室, 广州 510631,1. 华南师范大学生命科学学院, 广东省高校生态学与环境科学重点实验室, 广州 510631;2. 隆德大学生物学系, 隆德 SE-22362, 瑞典,华南师范大学生命科学学院, 广东省高校生态学与环境科学重点实验室, 广州 510631 |
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基金项目: | Natural Science Foundation of China (NSFC, No. 31070242), Research Fund for the Doctoral Program (20114407110006), Ministry of Education, China, the Leading Scientists Project of Guangdong Province, and the Guangdong Pearl River Scholar Funded Scheme (2012) |
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摘 要: | 为探究华南地区严重入侵植物五爪金龙(Ipomoea cairica)生物入侵的分子机制,对五爪金龙及其近缘种七爪金龙(I. digitata)和裂叶牵牛(I. nil)进行de novo转录组测序和组装,得到56551条unigenes,其中56522条得到注释,7815条GO注释,15615条COG注释,180201条KEGG数据库注释。转录组分析结果表明,五爪金龙氮代谢通路关键酶基因的表达高于对照。次生代谢关键酶(PAL、4CL、CAD、查耳酮合酶、苯基丙乙烯酮异构酶、槲皮黄3-O-甲基转移酶等)基因在五爪金龙与七爪金龙及裂叶牵牛中均得到协同性的差异表达,而这些代谢通路指导的产物合成对五爪金龙的抗逆境能力、生长、化感作用等均起关键作用。关键基因的RT-qPCR验证结果与转录组结果具有一致性。因此,这从分子生物学层面上对解释五爪金龙在华南地区的入侵机制提供了新的证据。
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关 键 词: | de novo 转录组 五爪金龙 生物入侵 代谢 |
收稿时间: | 2015/6/29 0:00:00 |
修稿时间: | 2015/9/25 0:00:00 |
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