DHRS4L2非编码RNA调控CPNE6基因表达 |
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引用本文: | 李一凡,黄东阳,王磊,杜冀晖,刘戈飞,王永,周蓓,李蓉,麦丽文.DHRS4L2非编码RNA调控CPNE6基因表达[J].中国生物化学与分子生物学报,2014,30(11):1098-1105. |
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作者姓名: | 李一凡 黄东阳 王磊 杜冀晖 刘戈飞 王永 周蓓 李蓉 麦丽文 |
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作者单位: | 广东医学院附属深圳南山医院中心实验室和深圳内源性感染重点实验室;汕头大学医学院细胞生物学教研室;广东医学院附属深圳南山医院胃肠外科 |
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基金项目: | Supported by National Natural Science Foundation of China (No. 31100943 );Shenzhen Nanshan Science and Technology Research Fund (No.2010012);Shenzhen City Science and Technology Project (No.201102136) ~~ |
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摘 要: | DHRS4/NRDR基因编码一种属于SDR家族的酶,在维甲酸合成、类固醇代谢和苯甲基代谢中发挥生物合成催化作用.DHRS4基因定位于14q11-2,有两个相似的拷贝基因,分别为DHRS4L2和DHRS4L1.我们前期发现了DHRS4L2基因一个上游转录起始位点,命名为DHRS4L2-Ea.在本研究中,我们用RT-PCR和双脱氧测序法发现一个新的从DHRS4L2-Ea转录的选择性剪接亚型DHRS4L2-900a(KC237374).同时RT-PCR结果显示在SK-N-SH细胞DHRS4L2-Ea选择性剪接亚型中DHRS4L2 iso(AY616183)表达最多,为主要亚型.在SK-N-SH细胞过表达DHRS4L2-800a(AY920361)使DHRS4L2-Ea 基因下游CPNE6 mRNA表达下调.在HeLa细胞过表达DHRS4L2 800a(AY920361)或DHRS4L2-900a(KC237374) 进一步表明DHRS4L2 Ea抑制CPNE6表达的作用.定量PCR结果显示si-RNA抑制DHRS4L2-Ea表达使CPNE6 mRNA表达上调.亚硫酸盐测序结果显示在SK-N-SH转染DHRS4L2-800a(AY920361)的样本中CPNE6基因DNA CpG甲基化增加.综上所述,本研究揭示DHRS4L2表达的非编码RNA抑制其下游基因CPNE6的表达.
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关 键 词: | DHRS4L2 CPNE6 选择性剪接 转录调控 人神经母细胞瘤 |
收稿时间: | 2014-05-23 |
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