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hsa-miR-381-3p靶基因预测及其相关信号通路的生物信息学分析
引用本文:唐乖,龙鼎新.hsa-miR-381-3p靶基因预测及其相关信号通路的生物信息学分析[J].生命科学研究,2018(3).
作者姓名:唐乖  龙鼎新
作者单位:南华大学公共卫生学院
摘    要:应用生物信息学方法分析miR-381-3p序列,预测其靶基因,并对靶基因进行蛋白质互作分析、功能富集分析及信号转导通路富集分析。结果发现,已知的成熟miR-381-3p序列在不同物种间高度保守。蛋白质互作分析显示,mi R-381-3p预测靶基因所编码蛋白质间存在复杂的相互作用,尤其是靶基因BTBD1、NUP160、STX16等编码的蛋白质,在互作中起关键作用。GO分析发现其靶基因集合可能参与细胞过程、生物调节、细胞大分子代谢等生物学过程;KEGG通路分析发现其靶基因集合显著富集于mTOR、Wnt、p53、MAPK等信号通路中。分析结果初步提示miR-381-3p通过调控靶基因广泛参与多种重要的生物学过程,为后续的实验性研究提供了线索。

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