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超快脉冲控制PCR(upPCR)技术及应用
作者姓名:景伟  马富强
作者单位:1)中国科学技术大学生物医学工程学院(苏州),生命科学与医学部,合肥 230026;2)中国科学院苏州生物医学工程技术研究所,中国科学院生物医学检验技术重点实验室,医药酶工程研究中心,苏州 215163,2)中国科学院苏州生物医学工程技术研究所,中国科学院生物医学检验技术重点实验室,医药酶工程研究中心,苏州 215163
基金项目:中科院青促会会员项目(2022327), 国家自然科学基金 (31900911),江苏省双创人才项目(JSJCRC2021548) 和科技部绿 色生物制造项目(2021YFC2104200) 资助。
摘    要:
在精准医疗、个性化医疗的大背景下,分子诊断在病原体检测、肿瘤诊断、优生优育、环境保护、食品安全等领域的应用越来越广泛,并逐渐向操作简单、快速准确、低成本、适用于基层及家庭使用的分子即时检测(point-of-care testing,POCT)方向发展。超快脉冲控制PCR(ultra-fast pulse-controlled PCR,upPCR)是实时荧光定量PCR(qPCR)技术的延伸和升级,该技术利用能量脉冲控制扩增反应中的金属加热元件(主要是纳米金),在几百微秒内完成溶液局部微环境的快速升温,实现模板DNA的解链变性,停止加热后反应微环境可被周围溶液快速冷却到聚合酶的延伸温度,实现引物退火和模板DNA的扩增,单个变性-扩增循环仅有1.5~5 s,远快于传统PCR(约90 s/循环),从而能够极大地加快扩增反应速度。
upPCR技术在保留了传统qPCR高灵敏度、高特异性和多重检测等优势的基础上,增加了超快速(低于15 min)、设备简单等新优势,非常适合用于基层检测等分子POCT场景。本文主要对upPCR技术的原理、设备、核心原料及在分子诊断中的应用进行综述,并对该技术存在的优缺点,以及未来的技术发展和应用趋势进行了讨论。


关 键 词:分子诊断  超快脉冲控制PCR  纳米金  分子即时检测
收稿时间:2022-10-30
修稿时间:2023-10-12
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