实时定量PCR评估金针菇的内参基因稳定性 |
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引用本文: | 贾定洪,王波.实时定量PCR评估金针菇的内参基因稳定性[J].菌物学报,2021,40(7):1700-1711. |
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作者姓名: | 贾定洪 王波 |
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作者单位: | 四川省农业科学院土壤肥料研究所 四川 成都 610066 |
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基金项目: | 国家食用菌产业技术体系项目(CARS-20);四川省科技计划项目(2021ZHFP0166);四川省科技计划项目(2016NYZ0040);四川省农业科学院项目(2019QYXK020) |
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摘 要: | 金针菇在中国和日本是最受人喜爱的食用菌之一,在重要栽培食用菌中产销量排名第四。近年来,已在活性物质、分子标记及基因鉴定方面开展了大量工作,但未见有金针菇内参基因稳定性研究的报道,导致金针菇基因表达研究无内源参考基因稳定性数据作为参考。本研究采用geNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFinder 4种软件评估18S核糖体RNA(18S)、28S核糖体RNA(28S)、60S核糖体蛋白L18(Rpl18)、肌动蛋白1(Act1)、3-磷酸甘油醛脱氢酶(Gapdh)、翻译延伸因子EF1-alpha(Ef1A)、DNA指导的RNA聚合酶亚基2(Rpb2)、细胞色素C氧化酶亚基1(Cox1)及细胞色素b(CytB)等9个内参基因的稳定性。综合分析结果显示,单个基因中Act1基因最稳定,CytB表达稳定性最差,但单个候选内参基因的稳定性不能够满足定量PCR实验要求;根据geNorm软件分析结果,CytB和Rpb2是金针菇定量PCR的稳定内参基因组合。本研究首次评估了金针菇的内参基因稳定性,将为后续的基因表达研究提供参考。
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关 键 词: | 实时定量PCR 金针菇 稳定性 基因表达 |
收稿时间: | 2020-12-14 |
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