| 西伯利亚蝗卵发育过程的比较转录组分析及滞育关联基因筛选 |
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| 引用本文： | 赵娜,吕雪峰,扈鸿霞,宋余,蒋思涵,季荣,叶小芳. 西伯利亚蝗卵发育过程的比较转录组分析及滞育关联基因筛选[J]. 昆虫学报, 2022, 65(9): 1075-1089. DOI: 10.16380/j.kcxb.2022.09.001 |
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| 作者姓名： | 赵娜 吕雪峰 扈鸿霞 宋余 蒋思涵 季荣 叶小芳 |
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| 作者单位： | (1. 新疆师范大学生命科学学院, 中亚区域跨境有害生物联合控制国际研究中心, 新疆特殊环境物种保护与调控生物学实验室, 乌鲁木齐 830054; 2. 新疆畜牧科学院畜牧业质量标准研究所, 乌鲁木齐830000) |
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| 摘 要： | 【目的】通过筛选西伯利亚蝗Gomphocerus sibiricus卵滞育基因及代谢通路，初步明确西伯利亚蝗卵滞育分子机理。【方法】利用Illumina NovaSeq 6000测序平台对西伯利亚蝗早期发育(ES)、滞育(DS)和滞育后发育阶段(PS)的卵进行转录组测序；采用GO和KEGG富集分析并结合文献，预测滞育相关通路并聚类热图分析，筛选蝗卵滞育关联基因，并选取其中6个重要基因进行qRT-PCR验证。【结果】DSvs ES和PS vs DS两比较组分别富集到12 419和4 789个差异表达基因，且多上调表达；两比较组共表达差异基因为2 206个，主要与糖代谢、环境胁迫和生长发育相关。DS vs ES组富集最显著的GO条目为蛋白结合，PS vs DS组GO条目主要包含酶活性、细胞骨架构建及蛋白结合等过程。滞育关联基因主要集中在Wnt信号通路、胰岛素信号通路、细胞周期通路以及昆虫激素生物合成等通路。6个重要的滞育关联基因的表达量变化趋势与转录组数据结果基本一致。【结论】本研究初步明确了西伯利亚蝗卵滞育调控的重要代谢途径，并筛选出20个滞育关联基因，为后续深入研究该物种的适应机理奠定了基础。
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| 关 键 词： | 西伯利亚蝗 卵 转录组 滞育关联基因 KEGG qRT-PCR |
Comparative transcriptome analysis and screening of diapause-associated genes during theegg development ofGomphocerus sibiricus(Orthoptera: Acrididae) |
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| ZHAO Na,LÜ Xue-Feng,HU Hong-Xia,SONG Yu,JIANG Si-Han,JI Rong,YE Xiao-Fang. Comparative transcriptome analysis and screening of diapause-associated genes during theegg development ofGomphocerus sibiricus(Orthoptera: Acrididae)[J]. Acta Entomologica Sinica, 2022, 65(9): 1075-1089. DOI: 10.16380/j.kcxb.2022.09.001 |
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| Authors: | ZHAO Na LÜ Xue-Feng HU Hong-Xia SONG Yu JIANG Si-Han JI Rong YE Xiao-Fang |
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| Affiliation: | (1. International Center for the Collaborative Management of Cross-border Pest in Central Asia, Xinjiang Key Laboratory of Special Species Conservation and Regulatory Biology, College of Life Science, Xinjiang Normal University, Urumqi 830054, China; 2. Institute of Animal Husbandry Quality Standards, Xinjiang Academy of Animal Sciences, Urmuqi 830000, China) |
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