| 梅EST-SSR标记的开发及利用 |
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| 引用本文： | 上官凌飞,李晓颖,宋长年,王西成,王玉柱,章镇,房经贵. 梅EST-SSR标记的开发及利用[J]. 西北植物学报, 2010, 30(9) |
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| 作者姓名： | 上官凌飞 李晓颖 宋长年 王西成 王玉柱 章镇 房经贵 |
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| 作者单位： | 1. 南京农业大学,园艺学院,南京,210095
2. 北京市农林科学院,林业果树研究所,北京,100093 |
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| 基金项目： | 教育部新世纪优秀人才支持计划 |
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| 摘 要： | 利用MISA软件对10 123条梅EST序列进行SSR位点查找,得到含SSR位点的序列935条,SSR位点1233个,平均每100条EST序列中含有12.18个SSR位点.2核苷酸、3核苷酸重复是最主要的重复类型,分别占35.52%和41.36%.设计了40对EST-SSR引物并进行扩增,有24对引物能扩增出理想的PCR 产物,其中17对引物具有较好的扩增多态性.测序后发现13对引物中有73.08%的片段具有相应的SSR位点,对杏DNA指纹中部分谱带的测序结果也证明了是梅扩增出的相应的SSR位点.根据本研究含有SSR位点的测序结果推算,从梅EST中开发真实SSR位点的数目为901.随机选择13对引物对杏和梅进行DNA指纹构建与遗传多样性分析,结果发现,来源于梅的EST-SSR引物在杏中有很高的通用性,这些引物把梅和杏分成了两大群体,说明他们是遗传差异明显的两种植物.
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| 关 键 词： | 梅 杏 遗传差异分析 |
Development of EST-SSR Markers in Prunus mume and Its Application |
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| SHANGGUAN Ling-fei,LI Xiao-ying,SONG Chang-nian,WANG Xi-cheng,WANG Yu-zhu,ZHANG Zhen,FANG Jing-gui. Development of EST-SSR Markers in Prunus mume and Its Application[J]. Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica, 2010, 30(9) |
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| Authors: | SHANGGUAN Ling-fei LI Xiao-ying SONG Chang-nian WANG Xi-cheng WANG Yu-zhu ZHANG Zhen FANG Jing-gui |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | EST-SSR |
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