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羽衣甘蓝SEPALLATA-like基因的系统发育与表达分析
引用本文:相元萍,黄云彤,贺洪军,徐启江.羽衣甘蓝SEPALLATA-like基因的系统发育与表达分析[J].生物工程学报,2020,36(11):2398-2412.
作者姓名:相元萍  黄云彤  贺洪军  徐启江
作者单位:1 青岛农业大学 园艺学院,山东 青岛 266109;2 黑龙江护理高等专科学校,黑龙江 哈尔滨 150086;3 德州市农业科学研究院,山东 德州 253015;3 德州市农业科学研究院,山东 德州 253015;4 东北林业大学 生命科学学院,黑龙江 哈尔滨 150040
基金项目:山东省现代农业 (蔬菜) 产业技术体系项目 (No. SDAIT-04-03),山东省良种工程项目 (No. 662-2316109),中央高校基本科研业务费专项资金 (Nos. 2572014EA03,2572020DY15),黑龙江省自然科学基金 (No. C2018002) 资助。
摘    要:E类MADS-box 基因SEPALLATA (SEP)-like在被子植物生殖生长特别是花器官发育方面具有重要作用。为分析羽衣甘蓝E功能MADS-box基因SEP-like基因的序列特征及其在花发育过程中的时空表达模式,以羽衣甘蓝品系‘14 line’为试材,利用cDNA末端快速扩增 (Rapid amplification of cDNA ends,RACE) 技术克隆了SEP直系同源基因BroaSEP1/2/3 (GenBank登录号:KC967957、KC967958、KC967960)。序列和系统进化树分析表明,这3个基因分别与野甘蓝 (Brassica oleracea var. oleracea)、芜菁Brassica rapa、萝卜Raphanus sativus、甘蓝型油菜Brassica napus的SEP1、SEP2、SEP3基因具有很高的同源性。推导的氨基酸序列显示,这些基因编码的蛋白质都包含高度保守的MADS结构域、I结构域和K结构域,每一基因都有其亚家族特异的C-末端功能域SEPⅠ和SEPⅡ基序。BroaSEP1、BroaSEP2、BroaSEP3基因的开放阅读框长度分别为801 bp、759 bp、753 bp,分别编码266、252、250个氨基酸残基。半定量RT-PCR和实时荧光定量PCR研究结果表明,BroaSEP1、BroaSEP2、BroaSEP3在发育的花芽中特异性表达,但是表达水平在不同发育时期以及野生型、多瓣型和少瓣型花芽中存在明显差异。

关 键 词:羽衣甘蓝,花发育,E类MADS-box基因,BroaSEP1/2/3基因
收稿时间:2020/7/11 0:00:00

Phylogenetic and expression analysis of SEPALLATA-like gene in Brassica oleracea L. var. acephala
Yuanping Xiang,Yuntong Huang,Hongjun He,Qijiang Xu.Phylogenetic and expression analysis of SEPALLATA-like gene in Brassica oleracea L. var. acephala[J].Chinese Journal of Biotechnology,2020,36(11):2398-2412.
Authors:Yuanping Xiang  Yuntong Huang  Hongjun He  Qijiang Xu
Institution:1 College of Horticulture, Qingdao Agricultural University, Qingdao 266109, Shandong, China;2 Heilongjiang Nursing College, Harbin 150086, Heilongjiang, China;3 Dezhou Academy of Agricultural Sciences, Dezhou 253015, Shandong, China; 3 Dezhou Academy of Agricultural Sciences, Dezhou 253015, Shandong, China;4 The College of Life Sciences, Northeast Forestry University, Harbin 150040, Heilongjiang, China
Abstract:
Keywords:kale (Brassica oleracea var  acephala)  flower development  E-class MADS-box genes  BroaSEP1/2/3 gene
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