| 计算生物学分析在基因组编辑研究中的应用 |
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| 引用本文： | 王滢,熊义春,陈佳,杨力.计算生物学分析在基因组编辑研究中的应用[J].生命的化学,2019(1):28-38. |
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| 作者姓名： | 王滢 熊义春 陈佳 杨力 |
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| 作者单位： | 中国科学院计算生物学重点实验室中国科学院-德国马普学会计算生物学伙伴研究所中国科学院上海生命科学研究院营养与健康研究院中国科学院大学;上海科技大学生命科学与技术学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31730111) |
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| 摘 要： | 基因组编辑是对基因组遗传信息进行定向改造的技术,其中CRISPR/Cas系统是目前应用最广泛的基因组编辑新技术。将先进的高通量测序以及相关计算生物分析应用于基因编辑研究,可进一步优化基因编辑效率和精度等检测流程,实现对全基因组功能基因筛选的监测。同时,利用基于生物信息及机器学习和深度学习等新方法,可对向导RNA(gRNA)的高效设计和实现对编辑效果的预测。本文将对计算生物学分析在CRISPR/Cas基因编辑系统的应用及研究进展等进行概述。
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| 关 键 词： | 基因组编辑 CRISPR/Cas gRNA 高通量测序 计算生物学 生物信息 机器学习 深度学习 |
Computational analysis in CRISPR/Cas genome editing |
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| WANG Ying,XIONG Yichun,CHEN Jia,YANG Li.Computational analysis in CRISPR/Cas genome editing[J].Chemistry of Life,2019(1):28-38. |
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| Authors: | WANG Ying XIONG Yichun CHEN Jia YANG Li |
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| Institution: | (Key Laboratory of Computational Biology,CAS-MPG Partner Institute for Computational Biology,Shanghai Institute of Nutrition and Health, Shanghai Institutes tor Biological Sciences,University of Chinese Academy of Sciences,Chinese Academy of Sciences,Shanghai 200031,China;School of Life Science and Technology,ShanghaiTech University,Shanghai 200031,China) |
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| Abstract: | WANG Ying;XIONG Yichun;CHEN Jia;YANG Li(Key Laboratory of Computational Biology,CAS-MPG Partner Institute for Computational Biology,Shanghai Institute of Nutrition and Health, Shanghai Institutes tor Biological Sciences,University of Chinese Academy of Sciences,Chinese Academy of Sciences,Shanghai 200031,China;School of Life Science and Technology,ShanghaiTech University,Shanghai 200031,China) |
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| Keywords: | genome editing CRISPR/Cas gRNA high-throughput sequencing computational biology bioinformatics machine learning deep learning |
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