白色念珠菌羊毛甾醇14α-去甲基化酶三维结构分子模型研究 |
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引用本文: | 季海涛,张万年,周有骏,朱杰,吕加国,朱驹.白色念珠菌羊毛甾醇14α-去甲基化酶三维结构分子模型研究[J].生物化学与生物物理学报,1998(6). |
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作者姓名: | 季海涛 张万年 周有骏 朱杰 吕加国 朱驹 |
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作者单位: | 第二军医大学药学院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金,军队“九五”重点课题 |
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摘 要: | 基于四种原核细胞色素P450晶体蛋白P450BM3、P450cam、P450terp、P450eryF模建白色念珠菌羊毛甾醇14α-去甲基化酶三维结构。序列匹配采用四种晶体结构比较结果基础之上提出的细胞色素P450超家族蛋白基于结构知识的序列匹配方法。以P450BM3晶体结构坐标模建目标蛋白结构保守区主链结构,结构保守区侧链构象来源于四种晶体蛋白与模建蛋白对应残基同源性得分最高残基构象。模建结果用分子力学和分子动力学进行结构优化,模建结果蛋白采用Profile-3D图、Ramachandran图和疏水图分析确证结构的合理性。并根据模型推测与血红素辅基相互作用的残基、与氧化还原偶联蛋白作用和参与电子传递的残基、底物进出通道和活性位点的残基。这些研究结果为定点突变研究、抗多肽抗体结合实验等提供理论依据,为高效低毒抗真菌药物合理设计提供靶标。
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关 键 词: | 羊毛甾醇14α-去甲基化酶 分子模建 底物对接 蛋白-蛋白相互作用 |
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