| 快速获取55型腺病毒基因组序列的方法 |
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| 作者姓名： | 刘媛 王文博 邹自英 冯子良 范泉水 熊杰 |
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| 作者单位： | 1. 成都军区总医院检验科 四川 成都 610083,2. 成都军区疾病预防控制中心 四川 成都 610021,1. 成都军区总医院检验科 四川 成都 610083,2. 成都军区疾病预防控制中心 四川 成都 610021,2. 成都军区疾病预防控制中心 四川 成都 610021,1. 成都军区总医院检验科 四川 成都 610083 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金青年项目(No. 81301445);全军后勤“十二五”重大专项(No. AWS11L009);全军医学科技青年培育项目(No. 14QNP057);上海市医学生物防护重点实验室开放课题(No. SKLM1401) |
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| 摘 要： | 【目的】建立快速获取55型腺病毒的全长基因组序列的方法。【方法】根据55型腺病毒的基因组特点,设计覆盖55型腺病毒基因组序列的12对引物,分别以55型腺病毒DNA为模板,扩增得到12个PCR产物,通过对12个PCR产物测序及序列拼接,获得55型腺病毒的全长基因组序列。【结果】从本院急性上呼吸道感染者咽拭子标本中分离得到一株55型腺病毒毒株SF04/SC/2016,以其DNA为模板扩增成功获得12个PCR产物,对其进行测序,并对12段序列进行拼接得到55型腺病毒的全长基因组序列,与已报到的各型腺病毒序列进行比对,采用邻位相连法构建系统发育进化树,所得序列与55型腺病毒处于同一分支,进一步确认该病原体为55型腺病毒。【结论】研究公布的序列和方法,能够实现更方便对腺病毒的快速测序,为揭示55型腺病毒的进化特点及制订疾病防控策略提供了有效手段。
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| 关 键 词： | 55型腺病毒 病原分离 全基因测序 序列拼接 |
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