| 土壤杆菌氧调控基因fnrN突变株发酵性能及基于RNA-Seq的基因表达 |
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| 引用本文： | 王永远,叶剑,郑志永,高敏杰,李佳佳,詹晓北.土壤杆菌氧调控基因fnrN突变株发酵性能及基于RNA-Seq的基因表达[J].微生物学通报,2017,44(10):2261-2268. |
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| 作者姓名： | 王永远 叶剑 郑志永 高敏杰 李佳佳 詹晓北 |
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| 作者单位： | 江南大学生物工程学院 糖化学与生物技术教育部重点实验室 江苏 无锡 214122,江南大学生物工程学院 糖化学与生物技术教育部重点实验室 江苏 无锡 214122,江南大学生物工程学院 糖化学与生物技术教育部重点实验室 江苏 无锡 214122,江南大学生物工程学院 糖化学与生物技术教育部重点实验室 江苏 无锡 214122,江南大学生物工程学院 糖化学与生物技术教育部重点实验室 江苏 无锡 214122,江南大学生物工程学院 糖化学与生物技术教育部重点实验室 江苏 无锡 214122 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(No. 31271888，31301408)；国家科技支撑计划项目(No. 2011BAD23B04)；江苏省普通高校研究生科研创新计划项目(No. SJLX15_0544) |
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| 摘 要： | 【目的】研究Crp家族转录调节因子fnr N突变对土壤杆菌ATCC 31749发酵性能和基因表达的影响。【方法】利用三亲结合法将构建的自杀式质粒p JQ-fnr N-kan导入土壤杆菌ATCC31749中,从而获得fnr N基因突变株(Δfnr N);分析Δfnr N的发酵特性;基于RNA-Seq对产胶期土壤杆菌ATCC 31749野生菌和Δfnr N差异表达基因进行分析。【结果】fnr N的突变使土壤杆菌合成热凝胶能力下降了22.0%,转录组分析发现在Δfnr N中186个基因表达发生显著性变化(|log2(|fold change|)|≥1且q≤0.001),其中65%的基因表达上调。热凝胶合成的关键基因crd ASC的表达受到不同程度的抑制,fnr N的突变使编码σ因子的ecf R和编码生物膜合成调节因子的sin R显著下调;Δfnr N菌中与细胞色素有关基因cyd AB、cy2、fix NOPQ的转录水平下调2-13倍。【结论】fnr N通过调控ecf R和sin R的表达调控热凝胶合成,通过调控fix NOPQ等基因的表达参与氧信号调控,该研究有助于丰富对土壤杆菌氧调控系统的认识。
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| 关 键 词： | 土壤杆菌，fnrN，基因突变，热凝胶，RNA-Seq |
Fermentation characteristics of Agrobacterium sp. with oxygen regulation gene fnrN mutation and genes expression analysis based on RNA-Seq |
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| WANG Yong-Yuan,YE Jian,ZHENG Zhi-Yong,GAO Min-Jie,LI Jia-Jia and ZHAN Xiao-Bei.Fermentation characteristics of Agrobacterium sp. with oxygen regulation gene fnrN mutation and genes expression analysis based on RNA-Seq[J].Microbiology,2017,44(10):2261-2268. |
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| Authors: | WANG Yong-Yuan YE Jian ZHENG Zhi-Yong GAO Min-Jie LI Jia-Jia and ZHAN Xiao-Bei |
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| Institution: | Key Laboratory of Carbohydrate Chemistry and Biotechnology of Ministry of Education, School of Biotechnology, Jiangnan University, Wuxi, Jiangsu 214122, China,Key Laboratory of Carbohydrate Chemistry and Biotechnology of Ministry of Education, School of Biotechnology, Jiangnan University, Wuxi, Jiangsu 214122, China,Key Laboratory of Carbohydrate Chemistry and Biotechnology of Ministry of Education, School of Biotechnology, Jiangnan University, Wuxi, Jiangsu 214122, China,Key Laboratory of Carbohydrate Chemistry and Biotechnology of Ministry of Education, School of Biotechnology, Jiangnan University, Wuxi, Jiangsu 214122, China,Key Laboratory of Carbohydrate Chemistry and Biotechnology of Ministry of Education, School of Biotechnology, Jiangnan University, Wuxi, Jiangsu 214122, China and Key Laboratory of Carbohydrate Chemistry and Biotechnology of Ministry of Education, School of Biotechnology, Jiangnan University, Wuxi, Jiangsu 214122, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Agrobacterium sp fnrN Gene mutation Curdlan RNA-Seq |
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