| 红豆杉免培养内生细菌多样性的初步研究 |
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| 引用本文： | 张晶晶,兰阿峰,邓百万,陈文强,孔亚男.红豆杉免培养内生细菌多样性的初步研究[J].微生物学通报,2013,40(5):766-774. |
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| 作者姓名： | 张晶晶 兰阿峰 邓百万 陈文强 孔亚男 |
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| 作者单位： | 1. 陕西理工学院生物科学与工程学院 陕西汉中 723001
2. 陕西理工学院生物科学与工程学院 陕西汉中 723001;陕西省食药用菌工程技术研究中心 陕西汉中 723001 |
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| 基金项目： | 陕西省重点实验室项目(No. 08JZ21); 陕西省教育厅项目(No. 08JK248, 08JK244) |
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| 摘 要： | 【目的】了解红豆杉(Taxus chinensis)内生细菌的组成及多样性。【方法】提取红豆杉组织总DNA,选用细菌通用引物799F和1492R对总DNA进行16S rDNA特异性扩增,构建红豆杉内生细菌16S rDNA克隆文库,对阳性克隆进行PCR-RFLP(限制性内切酶片段长度多态性)分析,并对酶切带谱不同的菌液进行测序,构建系统发育树。【结果】根据酶切带谱分析和测序结果的不同,将随机挑取的158个阳性克隆归为26个不同的可操作分类单元(OUTs),系统发育分析表明这些克隆序列分别属于变形菌门(Proteobacteria,包含Alpha、Beta、Gamma、Delta亚群)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)4个门。其中,变形菌门(Proteobacteria,占克隆总数的58.86%)为最优势类群。序列比对结果表明这些克隆序列分别与已报道的20个属具有较高的相似性。此外,还有一个OUTs在系统发育树上形成独立分支且未能确定其分类。【结论】红豆杉内生细菌多样性丰富,并且可能存在新的分类单元。
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| 关 键 词： | 免培养 红豆杉 内生细菌 多样性 |
Culture-independent analysis of endophytic bacterial
diversity in Taxus chinensis |
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| ZHANG Jing-Jing,LAN A-Feng,DENG Bai-Wan,CHEN Wen-Qiang and KONG Ya-Nan.Culture-independent analysis of endophytic bacterial
diversity in Taxus chinensis[J].Microbiology,2013,40(5):766-774. |
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| Authors: | ZHANG Jing-Jing LAN A-Feng DENG Bai-Wan CHEN Wen-Qiang and KONG Ya-Nan |
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| Institution: | 1. School of Biological Science and Engineering, Shaanxi University of Technology, Hanzhong,
Shaanxi 723001, China;1. School of Biological Science and Engineering, Shaanxi University of Technology, Hanzhong,
Shaanxi 723001, China 2. Shaanxi Engineering Research Center of Edible and Medicated Fungi, Hanzhong,
Shaanxi 723001, China;1. School of Biological Science and Engineering, Shaanxi University of Technology, Hanzhong,
Shaanxi 723001, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Culture-independent Taxus chinensis Endophytic bacterial Biodiversity |
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