6株0型口蹄疫病毒结构蛋白vpl基因的克隆与序列分析

提取6株O型口蹄疫病毒(FMDV)(T1-T6)的RNA，用一对通用引物经RT-PCR方法将6株FMDVVP1基因片段扩增出来。克隆测序，核苷酸序列分析表明，T1-T6六株vpl基因的核苷酸序列同源性在95％～99．8％之间，氨基酸序列同源性在94．8％～100％之间。T1-T6六株病毒vpl基因的核苷酸序列与已经发表的O／HKN／14／82、O/TAW/81，97、O／PHI／7／96、O／HKN／1／99和O／HKN／16／96的同源性较高，核苷酸序列同源性在86．1％～95．8％之间：发现6株毒株的主要中和抗原表位140-160、200-213位的氨基酸序列完全相同，推测它们有相近的中和抗体表位和抗原性。故推断本试验中的6株FMDV株属于同一基因型，即FMDV O型中国拓朴型(Cathay topotype)。