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基于枇杷转录组序列的SSR分子标记引物开发
引用本文:郑婷婷,魏伟淋,杨向晖,林顺权. 基于枇杷转录组序列的SSR分子标记引物开发[J]. 亚热带植物科学, 2015, 44(4): 274-278. DOI: 10.3969/j.issn.1009-7791.2015.04.002
作者姓名:郑婷婷  魏伟淋  杨向晖  林顺权
作者单位:(1.华南农业大学 园艺学院,广东 广州 510642;2.上饶市森林资源监测中心,江西 上饶 334000)
基金项目:广州市科技计划项目(201504010028)
摘    要:为获得更多的枇杷SSR引物,对枇杷转录组测序得到的1 kb以上的11 798条Unigenes进行SSR位点搜索。结果在3515 条Unigenes(6.77%)中共获得4438个SSR位点,其中主要重复类型为双碱基重复和三碱基重复,二者占SSR总数的68.27%,而四、五、六碱基重复类型较少,仅占1.42%。对选出的SSR标记采用Primer3进行引物设计,得到7911 对SSR位点特异引物,可用于枇杷遗传多样性分析、分子标记辅助育种、育种群体的建立等研究。

关 键 词:枇杷  转录组  SSR  
收稿时间:2015-10-20
修稿时间:2016-01-15

Development of SSR Molecular Markers Based on Transcriptome Sequencing of Eriobotrya japonica
ZHENG Ting-ting,WEI Wei-lin,YANG Xiang-hui,LIN Shun-quan. Development of SSR Molecular Markers Based on Transcriptome Sequencing of Eriobotrya japonica[J]. Subtropical Plant Science, 2015, 44(4): 274-278. DOI: 10.3969/j.issn.1009-7791.2015.04.002
Authors:ZHENG Ting-ting  WEI Wei-lin  YANG Xiang-hui  LIN Shun-quan
Affiliation:(1.College of Horticulture, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, Guangdong China; 2.Shangrao City Forest Resources Monitoring Center, Shangrao 334000, Jiangxi China)
Abstract:
Keywords:
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