三角帆蚌热休克蛋白60基因克隆及其表达分析 |
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引用本文: | 吴圣楠, 刘大伟, 刘毅, 胡宝庆, 张建强, 王艳, 王婷. 三角帆蚌热休克蛋白60基因克隆及其表达分析[J]. 水生生物学报, 2014, 38(5): 897-902. DOI: 10.7541/2014.134 |
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作者姓名: | 吴圣楠 刘大伟 刘毅 胡宝庆 张建强 王艳 王婷 |
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作者单位: | 1.江西师范大学生命科学学院, 南昌 330022 2. 南昌大学生命科学与食品工程学院, 南昌 330031 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31060359);江西省自然科学基金(20122BAB204017)资助 |
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摘 要: | 利用3'RACE技术, 对高通量转录组测序所得三角帆蚌HSP60基因(hcHSP60)长片段(2629 bp)进行了3'末端克隆, 经拼接得到hcHSP60 cDNA全长序列。采用多种分子生物学软件对hcHSP60 cDNA全长序列进行了特征分析, 并采用RT-PCR技术检测了其组织分布及经冷热应激后的表达变化。结果显示, hcHSP60 cDNA全长为2807 bp, 其中开放阅读框为1707 bp, 编码568个氨基酸, 预测分子量大小为61.04 ku, pH 7.0时的理论等电点为5.63。序列中不存在信号肽与跨膜结构。氨基酸序列保守性分析表明, hcHSP60氨基酸序列与光滑双脐螺HSP60同源性最高(达82%), 而与牙鲆、白云金丝鱼HSP60的同源性最低(为75%)。RT-PCR检测结果表明, hcHSP60在肝胰腺中的表达水平最高, 而在血液中的表达水平最低。30℃与35℃水温处理三角帆蚌4h后, 各组织中hcHSP60表达水平明显上升, 表明hcHSP60可能在三角帆蚌耐热应激反应中起着重要作用。
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关 键 词: | 三角帆蚌 热休克蛋白60 序列分析 表达 |
收稿时间: | 2013-08-11 |
修稿时间: | 2014-03-05 |
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