| 基于全基因转录组的结核诊断标识研究 |
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| 引用本文： | 陈献雄,杨倩婷,邱振纲,朱家楼,张明霞,邓国防,邓群益,陈心春.基于全基因转录组的结核诊断标识研究[J].中国科学:生命科学,2018(1). |
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| 作者姓名： | 陈献雄 杨倩婷 邱振纲 朱家楼 张明霞 邓国防 邓群益 陈心春 |
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| 作者单位： | 深圳大学医学部基础医学院病原生物学系;深圳市第三人民医院深圳市感染免疫重点实验室;赣南医学院第一附属医院; |
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| 摘 要： | 早期诊断是结核患者得到及时治疗的关键,目前结核病诊断手段不足,迫切需要更加快速、简便的诊断方法.本研究分析9例治疗前结核患者、6例结核潜伏感染者、6例健康对照的全基因转录组表达谱,并对结核患者治疗前后表达谱进行随访.结果发现,与健康对照和结核潜伏感染者比较,结核患者有77个高表达、50个低表达的差异表达基因,其中有12个差异表达基因表达量经抗结核治疗后下调;差异表达基因GO分析筛选出9个与炎症反应、免疫应答、趋药性相关的生物学功能通路,KEGG pathway分析发现,1个细胞因子和细胞因子受体相关的信号转导通路,各通路均有趋化因子或者细胞因子参与.应用RT-qPCR方法进行临床扩大样本验证,发现大部分基因RT-qPCR验证结果与基因芯片结果趋势一致,其中HBB等8个基因一致性最好;绘制ROC曲线评价HBB和TNFRSF10C两个基因诊断结核病的效能,AUC均在0.9以上,敏感性和特异性均在95%以上;本研究发现的差异表达基因为结核病研究提供了新的生物学标识,为结核病诊断方法的建立、疗效的监测、发病机制的揭示提供了新依据.
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