人参NBS-LRR抗病基因家族全基因组分析

人参(Panax ginseng C.A.Meyer)为传统名贵中药材,具有很高的药用价值和经济价值.人参药用部位为多年生宿根,生长周期长,土壤病害多,品质和产量受到严重制约.抗病基因是植物免疫过程中参与识别病菌、抵抗侵染及扩散的基因,是植物抗病性的分子生物学基础和选育抗病品种的重要分子标记.本文以人参全基因组草图为基础,运用生物信息学方法,根据基因结构及序列特征成功预测7个家族,共1652个人参抗病基因.通过与其他8种被子植物抗病基因家族比较,对人参抗病基因结构、家族进化特征进行初步分析.并使用13个转录本数据,系统分析人参抗病基因在不同部位和不同生长年限的表达模式,发现人参抗病基因具有明显的功能分化和器官特异性.以锈腐菌(Cylindrocarpon destructans)侵染不同时间后转录本表达模式,对病原体特异识别抗病基因NBS-LRR家族及其他基因进行关联分析,解析人参防御过程中次生代谢活动与病原微生物防御反应的协同作用,本工作将为人参产业的可持续发展奠定基础.