| 前列腺癌多阶段相关枢纽蛋白的差异共表达模式 |
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| 引用本文： | 周成贵,姚晨,李红东,郭政.前列腺癌多阶段相关枢纽蛋白的差异共表达模式[J].生物信息学,2011,9(1):20-23. |
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| 作者姓名： | 周成贵 姚晨 李红东 郭政 |
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| 作者单位： | 1. 电子科技大学生命科学与技术学院生物信息学中心,四川,成都,610054
2. 电子科技大学生命科学与技术学院生物信息学中心,四川,成都,610054;哈尔滨医科大学生物信息学系,黑龙江,哈尔滨,150086 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(30670539,30770558) |
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| 摘 要： | 通过枢纽蛋白与其互作邻居之间的共表达关系在从前列腺正常组织到原位癌及原位癌到转移的两个发展阶段的变化,寻找在前列腺癌发生和发展过程中动态改变的枢纽蛋白,为探讨前列腺癌的发病与转移机理提供线索。基于前列腺正常组织、原位癌与癌转移后组织的基因表达谱数据,在前列腺癌的两个发展阶段分别检测到1578和2347个动态改变的枢纽蛋白。平均超过95%的在一个发展阶段动态改变的枢纽蛋白与在另一发展阶段动态改变的枢纽蛋白中的至少一个蛋白共享显著多的互作邻居。另外,两组动态改变的枢纽蛋白中有780个交叠蛋白,其中大约50%的蛋白与其互作邻居之间的共表达关系在两个发展阶段的强弱变化方向相反。结果提示,在前列腺癌的发生和发展过程中,动态改变的枢纽蛋白影响的功能通路高度一致,但是它们与其互作邻居之间有着不同的共表达模式。
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| 关 键 词： | 枢纽蛋白 共表达 相关 前列腺癌 转移 |
Differential co-expression patterns of the hub proteins correlated with multiple stages of prostate cancer |
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| ZHOU Cheng-gui,YAO Chen,LI Hong-dong,GUO Zheng.Differential co-expression patterns of the hub proteins correlated with multiple stages of prostate cancer[J].China Journal of Bioinformation,2011,9(1):20-23. |
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| Authors: | ZHOU Cheng-gui YAO Chen LI Hong-dong GUO Zheng |
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| Institution: | ZHOU Cheng-gui1,YAO Chen1,LI Hong-dong1,GUO Zheng1,2 (1.Bioinformatics Centre and School of Life Science,University of Electronic Science and Technology of China,Chengdu 610054,China,2.College of Bioinformatics Science and Technology,Harbin Medical University,Harbin 150086,China) |
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| Abstract: | According to the alterations of co-expression relationships between hub proteins and their interacting partners at two developmental stages,from normal prostate to primary prostate cancer and from primary prostate tumor to metastatic prostate cancer respectively,we found the hub proteins with dynamic changes during the occurrence and development of prostate cancer.This could suggest hints for exploring the occurrence and metastasis mechanisms of prostate cancer.Based on three datasets of expression profiles... |
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| Keywords: | hub proteins co-expression correlation prostate cancer metastasis |
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