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对虾白斑综合征病毒基因组快速定性定量方法的建立
引用本文:冯博,孙晓红,潘迎捷,赵勇.对虾白斑综合征病毒基因组快速定性定量方法的建立[J].微生物学杂志,2013(4):18-21.
作者姓名:冯博  孙晓红  潘迎捷  赵勇
作者单位:上海海洋大学食品学院 上海水产品加工贮藏工程技术研究中心 农业部水产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室(上海);上海海洋大学食品学院上海水产品加工贮藏工程技术研究中心 农业部水产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室(上海)
基金项目:国家自然科学基金面上项目(31271870);上海市科委部分地方院校能力建设项目(11310501100);上海市科委科技创新行动计划项目(12391901300);上海市科委工程中心建设项目(11DZ2280300)
摘    要:对于对虾白斑综合征病毒(white spot syndrome virus,WSSV)全基因组样品,使用限制性内切酶酶切以及荧光绝对定量的方法进行分析,建立了WSSV全基因组快速定性定量的方法。定性实验通过对GenBank中WSSV基因组序列深度分析,选择确定合适的限制性内切酶BamHI对基因组进行酶切,通过比对实际酶切结果和软件模拟酶切结果,以定性待测样品。定量实验使用荧光定量试剂盒,通过建立标准曲线的方法对未知浓度的WSSV基因组样品进行绝对定量。实验结果表明,结合使用酶切分析和荧光定量的方法可以准确、快速、方便、经济地对WSSV基因组样品进行定性定量分析,为进一步深入研究WSSV基因组奠定坚实基础。

关 键 词:对虾白斑综合征病毒  全基因组  酶切分析  荧光绝对定量
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