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基因组原位杂交鉴定牛筋草AA基因组在穇子染色体上的分布及探针长度优化方法
作者姓名:姜斌  刘利勤  胡晓颖  刘青
作者单位:1. 中国科学院华南植物园,中国科学院植物资源保护与可持续利用重点实验室,广州 510650;中国科学院研究生院,北京 100049
2. 云南瑞升烟草技术(集团)有限公司,昆明,650106
3. 中国科学院华南植物园,中国科学院植物资源保护与可持续利用重点实验室,广州 510650
基金项目:国家自然科学基金项目(30700043);中国科学院植物资源保护与可持续利用重点实验室基金项目(200922);教育部留学回国人员科研启动基金项目(2011-1139);中国科学院生命科学领域基础前沿研究专项(KSCX2-EW-J-28)资助
摘    要:采用基因组原位杂交(Genomic in situ hybridization,GISH)方法研究了牛筋草(Eleusine indica)AA基因组在穇子(E.coracana)染色体上的分布,并探讨了AA、BB基因组的同源关系。用超声波破碎法进行预剪切,以缺口平移法标记的牛筋草总DNA为探针,BB基因组的E.floccifolia(Forssk.)Spreng.总DNA为封阻,与AABB基因组穇子的中期染色体进行杂交。结果表明,牛筋草AA基因组分布在穇子的18条染色体上。不加封阻或加过量封阻均不能鉴别AA基因组,说明AA和BB基因组间的分化程度不大,双方共享的重复序列较多。牛筋草与E.floccifolia总DNA分别用超声波破碎2 min和3 min后,可得到峰值为300-750 bp的DNA片段,这说明不同物种的超声波破碎时间需要调整,以获得合适长度的探针。

关 键 词:AA基因组  穇子  基因组原位杂交  剪切方法
收稿时间:2011-07-12
修稿时间:2011-08-30
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