广西蚕沙细菌组成多样性解析和VBNC菌群的发掘 |
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作者姓名: | 张艳军 陈宝婷 张玉梅 张逸飞 朱宝琳 苏盼 丁林贤 谢乃钧 张萍华 |
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作者单位: | 浙江师范大学化学与生命科学学院, 浙江 金华 321004;浙江师范大学地理与环境科学学院, 浙江 金华 321004;广西靖西鑫晟茧丝绸科技有限公司, 广西 靖西 533800 |
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基金项目: | 浙江省自然科学基金(LY19C130002);浙江省肠道微生态重点实验室开放课题(2019KLGM011) |
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摘 要: | 【目的】解析广西蚕沙中细菌群落组成与多样性,为蚕沙中菌种资源发掘和蚕沙的综合利用提供科学依据。【方法】通过高通量测序技术研究细菌群落组成特征,同时利用常规稀释涂布平板法和基于复苏促进因子(Rpf)的MPN培养系统解析并筛选蚕沙中可培养和活的非可培养(VBNC)状态的优势菌群,并经16SrRNA基因测序对筛选得到的菌株作初步分类鉴定。【结果】高通量测序表明,广西蚕沙样品中细菌归属于10个门、18个纲、27个目、57个科、96个属,其中4个属的丰度达1%以上,优势菌群为变形菌门(Proteobacteria)肠杆菌属(Enterobacter);通过稀释涂布平板法共获得14个属的33株可培养细菌,其中4个属(Citrobacter、Weissella、Chitinophaga、Pseudoclavibacter)在高通量测序中未被检测到;而在MPN培养系统中,基于复苏促进因子的处理组细菌总数最大检出丰度提高了100倍,并从中共检出21株对Rpf敏感的VBNC菌株,其中6个属(Paenibacillus、Caulobacter、Roseomonas、Pantoea、Erwinia、Acine...
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关 键 词: | 复苏促进因子 活的非可培养状态 高通量测序 蚕沙 细菌多样性 |
收稿时间: | 2020-01-08 |
修稿时间: | 2020-03-16 |
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