| 利用杉木的F1代群体构建遗传连锁图谱 |
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| 引用本文： | 童春发,施季森. 利用杉木的F1代群体构建遗传连锁图谱[J]. 遗传学报, 2004, 31(10): 1149-1156 |
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| 作者姓名： | 童春发 施季森 |
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| 作者单位： | 童春发（南京林业大学林木遗传和基因工程实验室,南京,210037）;施季森（南京林业大学林木遗传和基因工程实验室,南京,210037） |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究规划"973"项目(编号:TG1999016004)和江苏省基础研究计划项目(编号:BK2003098)资助[SupportedbytheNational Major Basic Research Developmental Program (No. TG1999016004) and the BasicResearch Program of JiangsuProvince (No. BK2003098)] |
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| 摘 要： | 对于杉木11分离的分子标记位点,提出了一种新的构建遗传连锁图谱的策略.通过二点连锁分析,任意两个位点的连锁相和重组率可以得到推断和估计.对于一个连锁群中的最优排序,采用隐马尔可夫链模型的方法进行多位点的连锁分析.该作图方法比通常林木上所用的"拟测交"作图方法更有效.采用该作图策略,利用句容0号无性系(♀)×柔叶杉(♂)的F1代群体的AFLP分子标记数据重建了句容0号无性系和柔叶杉的遗传连锁图谱.在句容0号无性系的连锁图谱中,有101个标记分布在11个连锁群上,图谱的总长度为2282.6 cM,平均图距为22.6 cM,单个连锁群上最多含有17个标记,最少含有5个标记;在柔叶杉的连锁图谱中,有94个标记分布在11个连锁群上,图谱的总长度为2565.8 cM,平均图距为27.3 cM,单个连锁群上最多含有16个标记,最少含有4个标记.构建的句容0号无性系和柔叶杉的遗传连锁图谱比原有的图谱分别增加了26个标记和28个标记,双亲的图谱共增加了54个AFLP标记,使图谱上的分子标记总数达到195个,双亲遗传图谱的跨度均超过了2000 cM,基本上达到了杉木基因组的长度,图谱的覆盖率接近于100%.利用新的作图方法可以较大提高分子标记在图谱上的分辨率,得到可认为是覆盖了整个基因组的遗传连锁框架图.
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| 关 键 词： | 杉木 遗传连锁图谱 F1代群体 连锁相 隐马尔可夫链模型 |
| 文章编号： | 0379-4172(2004)10-1149-08 |
| 修稿时间： | 2003-10-23 |
Constructing Genetic Linkage Maps in Chinese Fir Using F1 Progeny |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Chinese fir genetic linkage maps F_1 progeny linkage phase hidden Markov chain model |
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