| 汉滩病毒西安分离株84FLi的L片段核苷酸序列测定以及分析 |
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| 引用本文： | 李新红,杨为松,杭长寿,白雪帆,马本江,黄长形,李光玉,张岩.汉滩病毒西安分离株84FLi的L片段核苷酸序列测定以及分析[J].中国病毒学,2002,17(3):221-225. |
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| 作者姓名： | 李新红 杨为松 杭长寿 白雪帆 马本江 黄长形 李光玉 张岩 |
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| 作者单位： | 1. 第四军医大学唐都医院全军感染病中心,陕西西安,710038
2. 中国预防医学科学院病毒学研究所,北京,100052 |
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| 摘 要： | 采用逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR),分节段扩增汉滩病毒 84FLi株的L基因片段cDNA,纯化的PCR产物片段直接用于序列测定或克隆入pND18-T载体中 进行测序.结果表明,84FLi株的L片段cDNA由6533个核苷酸组成,四种核苷酸的比例分别为A33.39%,C16.43%,G20. 74%,T29.44%.GC含量为37.17%,AT含量为62.83%.推导出的最大开放读码框架为从38到649 3 ,共编码2151个氨基酸.序列同源性分析表明,84FLi株核苷酸与HTN型国际标准毒株76-11 8的同源性为83.7%,差异性为18.8%;而与中国株A9的同源性高达97.6%,差异性仅为2.4%. 与SEO型代表Seoul80-39的同源性为75.2%,66.1%～66.5%.L片段的氨基酸比较分析表明, L 片段与HTN型间的同源性为97.5%～98.0%,而与SEO型的同源性为83.5%～85.5%.与PUC、TUL 、SN和AND等其它型汉滩病毒的同源性仅为68.6%～69.6%.结果表明84FLi株属于HTN型,并与分离自国内的HTN型病毒高度同源.
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| 关 键 词： | 汉滩病毒84FLi株 L片段 序列测定 系统发生树 |
| 文章编号： | 1003-5125(2002)03-0221-05 |
| 修稿时间： | 2002年1月4日 |
Sequence Analysis of Complete L Segment of 84FLi,a Hantann Virus Isolated from Xi'an |
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