| 水稻NAM基因家族的全基因组鉴定及表达分析 |
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| 引用本文： | 陈琼琼,Abdullah Shalmani,陈云波,黄洋彬,陈坤明,李文强. 水稻NAM基因家族的全基因组鉴定及表达分析[J]. 西北植物学报, 2020, 40(6): 907-917 |
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| 作者姓名： | 陈琼琼 Abdullah Shalmani 陈云波 黄洋彬 陈坤明 李文强 |
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| 作者单位： | (西北农林科技大学 生命科学学院，旱区作物逆境生物学国家重点实验室，陕西杨陵 712100) |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31570181)； |
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| 摘 要： | 植物特异性转录因子NAM家族从属于NAC转录因子超家族，在植株生长发育、生理代谢以及应对各种胁迫反应中均发挥重要作用。该研究采用生物信息学方法鉴定水稻基因组中的NAM基因，分析其时空表达模式、亚细胞定位以及蛋白相互作用，并采用实时定量qRT PCR方法分析不同外源激素(如SA、ABA和MeJA)以及非生物胁迫(包括干旱、盐和冷)处理下各NAM基因的表达特征，为进一步探索NAM基因在非生物胁迫中的功能和应激机制以及激素调控途径奠定基础。结果显示：(1)从水稻基因组中共鉴定出48个NAM基因，进化分析将其分为5个亚家族；NAM基因在水稻基因组中存在9对片段复制事件。(2)组织表达分析显示，NAM基因在水稻不同组织及发育时期表现特异性表达，特别是叶鞘、茎和节的生长过程中高表达，且大多数是核定位，并存在多种蛋白互作。(3)实时定量qRT PCR表达分析显示，10个NAM基因在不同组织中均特异表达；大部分NAM基因在盐和干旱胁迫下表达上调，而在冷胁迫下表达降低；SA、ABA和MeJA处理均可显著改变各NAM基因的表达水平。研究表明，NAM基因在水稻生长发育、激素应答和非生物胁迫响应中具有重要作用。
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| 关 键 词： | 水稻；NAM家族；非生物胁迫；激素应答；基因表达 |
Genome wide Identification and Expression Analysis of NAM Gene Family in Rice |
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| CHEN Qiongqiong,SHALMANI Abdullah,CHEN Yunbo,HUANG Yangbin,CHEN Kunming,LI Wenqiang. Genome wide Identification and Expression Analysis of NAM Gene Family in Rice[J]. Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica, 2020, 40(6): 907-917 |
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| Authors: | CHEN Qiongqiong SHALMANI Abdullah CHEN Yunbo HUANG Yangbin CHEN Kunming LI Wenqiang |
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| Keywords: | rice (Oryza sativa L.) NAM gene family abiotic stress hormone response gene expression |
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