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假结核耶尔森氏菌中Phd-Doc毒素-抗毒素系统的功能鉴定
引用本文:杨昶杏,孟凡能,张文越,杨培钰,王丹丹,刘兴宇,王瑶,沈锡辉.假结核耶尔森氏菌中Phd-Doc毒素-抗毒素系统的功能鉴定[J].微生物学通报,2021,48(10):3554-3568.
作者姓名:杨昶杏  孟凡能  张文越  杨培钰  王丹丹  刘兴宇  王瑶  沈锡辉
作者单位:旱区作物逆境生物学国家重点实验室 陕西省农业与环境微生物重点实验室 西北农林科技大学生命科学学院 陕西 杨凌 712100;庆阳陇沣海绵城市建设管理运营有限责任公司 甘肃 庆阳 745000;北京有色金属研究总院 北京 100088
基金项目:国家重点研发计划(2018YFA0901200);国家自然科学基金(31725003,31970114,31671292);庆阳陇沣海绵城市建设管理运营公司小崆峒沟道项目综合治理项目(QYLF-JSYY-2020029)
摘    要:【背景】毒素-抗毒素系统在微生物体内广泛存在,在微生物对抗外界不良环境方面发挥重要作用。【目的】以模式细菌假结核耶尔森氏菌(Yersinia pseudotuberculosis,Yptb)为材料,探究其编码的Phd-Doc毒素-抗毒素系统的作用机制和生物学功能。【方法】通过生物信息学方法预测Yptb中编码的Phd-Doc毒素-抗毒素系统,通过毒性分析、基因表达分析及蛋白相互作用对其进行鉴定;通过抗生素胁迫、氧胁迫、生物被膜形成等实验研究Phd-Doc在体内发挥的生物学功能。【结果】生物信息学分析鉴定出一对Phd-Doc毒素-抗毒素系统,发现二者共转录且相互作用;毒素蛋白Doc能够引起大肠杆菌形态发生变化并抑制其生长,抗毒素蛋白Phd能中和Doc的毒性;Phd-Doc毒素-抗毒素系统具有自调控抑制效应;phd-doc的缺失对Yptb自身的生长无影响,而且毒素蛋白Doc在野生型Yptb内过表达并未显示毒性;phd-doc在转录水平上响应了抗生素胁迫和氧胁迫,其中,对氯霉素胁迫最为敏感,但并不影响Yptb的生长;同时,Phd-Doc能够影响Yptb的生物被膜形成能力。【结论】Yptb中Phd-Doc毒素-抗毒素系统的功能鉴定对于更好地了解在多变的外部环境下微生物的定殖和响应机制具有重要意义。

关 键 词:毒素-抗毒素系统  Phd-Doc  自体调控  环境胁迫  生物被膜
收稿时间:2021/1/2 0:00:00

Functional characterization of Phd-Doc toxin-antitoxin system in Yersinia pseudotuberculosis
YANG Changxing,MENG Fanneng,ZHANG Wenyue,YANG Peiyu,Wang Dandan,LIU Xingyu,WANG Yao,SHEN Xihui.Functional characterization of Phd-Doc toxin-antitoxin system in Yersinia pseudotuberculosis[J].Microbiology,2021,48(10):3554-3568.
Authors:YANG Changxing  MENG Fanneng  ZHANG Wenyue  YANG Peiyu  Wang Dandan  LIU Xingyu  WANG Yao  SHEN Xihui
Institution:State Key Laboratory of Crop Stress Biology for Arid Areas, Shaanxi Key Laboratory of Agricultural and Environmental Microbiology, College of Life Sciences, Northwest A&F University, Yangling, Shaanxi 712100, China;Qingyang Longfeng Sponge City Construction Management Operation Company, Qingyang, Gansu 745000, China;General Research Institute for Nonferrous Metals, Beijing 100088, China
Abstract:
Keywords:toxin-antitoxin system  Phd-Doc  autoregulation  environmental stress  biofilm
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