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副溶血性弧菌重复序列-PCR分型研究
引用本文:金莉莉,董 雪,王秋雨,李 雪,吴 琼,李继耀.副溶血性弧菌重复序列-PCR分型研究[J].微生物学通报,2008,35(3):0389-0394.
作者姓名:金莉莉  董 雪  王秋雨  李 雪  吴 琼  李继耀
作者单位:1. 辽宁大学生命科学学院,沈阳,110036
2. 沈阳市疾病预防控制中心,沈阳,110037
基金项目:辽宁省沈阳市科技局资助项目
摘    要:利用基因外重复回文序列-PCR(REP-PCR)和肠细菌基因间共有重复序列-PCR(ERIC-PCR)技术,对副溶血性弧菌进行了分子分型研究和亲缘关系的探讨,并使用Hunter和Gaston方法计算分辨力指数.结果显示40株副溶血性弧茵分离株均可扩增产生可重复的DNA指纹图谱,并且不同菌株基因组DNA的扩增条带具有多态性.根据SPSS10.0软件得出的树状图结果,REP-PCR可以把40株茵分为21个型,分辨力指数可达到0.953,优势菌型为G1型;ERIC-PCR可将40株菌分成4个型,分辨力指数为0.5.研究显示重复序列-PCR方法可以用于该菌分型分析,REP-PCR具有较好的分型能力.在两种PCR的DNA指纹图谱中,血清型O1群与O3群主条带均非常相似,表明它们之间亲缘关系密切.

关 键 词:副溶血性弧菌  基因外重复回文序列-PCR  肠细菌基因间共有重复序列-PCR  分型  亲缘关系  副溶血性弧菌  重复序列  分型  研究  Element  parahaemolyticus  Vibrio  相似  群主  血清型  能力  分析  菌型  优势  树状图  软件  多态性  扩增条带  基因组  菌株
修稿时间:2007年7月2日

Typing of Vibrio parahaemolyticus by Repetitive Element Sequence-based PCR
JIN Li-Li,DONG Xue,WANG Qiu-Yu,LI Xue,WU Qiong and LI Ji-Yao.Typing of Vibrio parahaemolyticus by Repetitive Element Sequence-based PCR[J].Microbiology,2008,35(3):0389-0394.
Authors:JIN Li-Li  DONG Xue  WANG Qiu-Yu  LI Xue  WU Qiong and LI Ji-Yao
Institution:Life School of Liaoning University, Shenyang 110036;Shenyang Center for Disease Control and Prevention, Shenyang 110037;Life School of Liaoning University, Shenyang 110036;Life School of Liaoning University, Shenyang 110036;Life School of Liaoning University, Shenyang 110036;Shenyang Center for Disease Control and Prevention, Shenyang 110037
Abstract:
Keywords:Vibrio Parahaemolyticus  Repetitive extragenic palindromic elements-PCR  Enterobacterial repetitive intergenic consensus sequences-PCR  Typing  Genetic relationship
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