免疫相关基因FGF13、GZMB、FLT3、CRLF3可能与急性髓系白血病患者预后密切相关 |
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作者姓名: | 刘琼芝 黄文丽 |
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作者单位: | 1. 长沙市中心医院;2. 长沙金域医学检验实验室有限公司 |
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摘 要: | 为了构建急性髓系白血病(AML)患者的预后风险模型,本研究通过IMMPORT数据库提取免疫基因,通过基因表达综合(GEO)数据库和AML相关转录组RNA测序数据集筛选差异表达的免疫基因,基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载AML相关的表达谱数据集(TCGA-LAML)及临床数据,对差异表达的免疫基因进一步进行单因素COX回归分析和多因素COX回归分析,最终确定了关键免疫基因,随后根据免疫基因进行单基因预后分析以及免疫浸润分析。结果显示:与正常对照组相比,在AML患者的骨髓样本中,有55个免疫基因显著上调或下调,其中由4个免疫基因(FGF13、GZMB、FLT3、CRLF3)构建的风险模型能预测AML患者的预后[曲线下面积(AUC)=0.741];高风险组和低风险组之间免疫细胞的含量存在显著差异,其中FGF13、CRLF3为低风险基因,GZMB、FLT3为高风险基因。这为4个免疫基因FGF13、GZMB、FLT3、CRLF3及其构建的风险模型用于监测AML患者的预后和免疫浸润情况提供了理论基础。
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关 键 词: | 急性髓系白血病 免疫浸润 预后 免疫基因 生物信息学 |
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