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黄瓜花叶病毒坏死型卫星RNA的cDNA克隆和全序列分析
引用本文:程宁辉,濮祖芹,方中达,方荣祥.黄瓜花叶病毒坏死型卫星RNA的cDNA克隆和全序列分析[J].中国科学C辑,1997,27(2):156.
作者姓名:程宁辉  濮祖芹  方中达  方荣祥
作者单位:1.南京农业大学植保系 南京210095 2.复旦大学遗传研究所,上海200433
摘    要:从田间发生坏死病害的番茄病株中分离得到黄瓜花叶病毒TN分离物,经研究证实TN分离物带有1株坏死型卫星RNA(TN-SatRNA).利用已知CMV卫星RNA的两端序列作引物扩增并克隆了TN-SatRNA的cDNA.序列分析显示TN-SatRNA全长为390个核苷酸.比较TN-SatRNA与富有代表性的CMV卫星RNA的结构表明,这几种卫星RNA中具有4个结构同源区(Ⅰ:1~81nt,Ⅱ:216~261nt,Ⅲ:278~338nt;Ⅳ:349~390nt),而在82~215nt的区域几种卫星RNA的结构变化较大.在TN-SatRNA的3’端具有已报道的坏死型卫星RNA特征性序列结构.经3’RACE方法确定TN-SatRNA的3’端自然序列,与PCR扩增引物有1个核苷酸的差别.

关 键 词:黄瓜花叶病毒  卫星RNA  cDNA克隆  序列分析
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