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粪产碱菌nif H,nif D和部分nif K的克隆、定位及序列分析
引用本文:张海予,萧凤回,朱新生,林敏,方宣钧,尤崇杓,朱玉贤.粪产碱菌nif H,nif D和部分nif K的克隆、定位及序列分析[J].中国科学C辑,1997,27(6):492.
作者姓名:张海予  萧凤回  朱新生  林敏  方宣钧  尤崇杓  朱玉贤
作者单位:1. 北京大学蛋白质工程及植物基因工程国家重点实验室 北京100871 2.中国农业科学院原子能利用研究所 北京100094 3.云南农业大学农业科学和技术学院 昆明650201
摘    要:提取粪产碱菌(Alcaligenes faecalis)总DNA,经限制性内切酶酶切和琼脂糖凝胶电泳,以含肺炎克氏杆菌(Klebsiella pneumoniae)nif H和nif H-D基因的DNA片段为探针进行Southern杂交,筛选出与nif HDK同源的4.6kb片段,克隆到pBluesript SK~+载体上,构建了重组质粒pBZl.经亚克隆、酶切、DNA序列分析后发现,粪产碱菌具有与其它固氮菌相似的结构特征,其nif HDK共用1个启动子,具有上游激活序列UAS,RNA聚合酶σ54因子识别序列、1个A-T富集区和SD序列.nifH和nif D的阅读框架分别为888和1476bp,GC含量各为61.6%和60.2%.nifH-nif D和nif D-nif K的基因间隔区长度分别为101和105bp,各存在1个7bp的反向重复和1个SD序列.由阅读框架(ORF)推导的铁蛋白和钼铁蛋白α亚基的氨基酸序列与其它固氮菌相比有较高的同源性,高度保守的氨基酸残基所处的位置也很相似.同源性比较说明,粪产碱菌与棕色固氮菌(Azotobacter vinelandii)同源性最高.

关 键 词:粪产碱菌  固氮酶基因  克隆  序列分析
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