核小体及染色质修饰的基因组分布模式和染色质状态 |
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作者姓名: | 刘宏德 罗坤 马昕 翟金城 谢建明 孙啸 万亚坤 |
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作者单位: | 东南大学生物电子学国家重点实验室,南京 210096,新疆医科大学第一附属医院神经外科,循证医学研究所,乌鲁木齐 830054,南京审计学院金审学院, 南京 211815,东南大学生物电子学国家重点实验室,南京 210096,东南大学生物电子学国家重点实验室,南京 210096,东南大学生物电子学国家重点实验室,南京 210096,东南大学生命科学研究院,南京 210096 |
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基金项目: | 新疆维吾尔自治区自然科学基金(2012211A076), 国家重点基础研究发展计划(973)(2012CB316501), 国家自然科学基金(31240080, 31371339)和江苏省自然科学基金(12KJD520006)资助项目 |
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摘 要: | 染色质是真核DNA的存在方式,可以通过影响DNA的可及性调节基因转录,其基本单元为核小体,系由约147 bp的DNA缠绕在组蛋白八联体上形成的结构,核小体之间以连接DNA相连.核小体组蛋白上能发生甲基化和乙酰化等化学修饰.核小体位置、DNA的甲基化和组蛋白的修饰等对染色质状态(常染色质或异染色质)及基因组之间的长程相互作用有重要影响.近年,基于高通量测序技术,核小体位置和染色质修饰在多种细胞中的基因组分布已被测定.结果显示,这些标记的分布模式具有位点特异、动态变化、相互偶联和高度复杂的特征.本文详细回顾并评述了核小体位置和染色质修饰的分布模式、对应生物学功能、修饰之间的关联、实验测定技术、染色质状态的计算分析等内容.该工作对于深入认识和理解染色质的表观遗传调节机制有重要意义.
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关 键 词: | 染色质 核小体 组蛋白修饰 分布模式 高通量DNA测序 |
收稿时间: | 2012-09-01 |
修稿时间: | 2013-03-13 |
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